民事起诉立案后撤诉，法院确实会对案件进行存档。以下从多个角度为你详细分析：
存档的必要性
法律程序要求：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院在受理案件后，无论案件最终如何处理（包括撤诉），都会形成相应的诉讼档案。这些档案是法院审判活动的重要记录，具有法律效力，是司法程序不可或缺的一部分。
保障当事人权益：
- 存档有助于保障当事人的合法权益。如果未来发生争议或需要查询案件相关信息，当事人可以依法向法院申请查阅、复制卷宗材料，从而维护自己的合法权益。
司法统计与监督：
- 存档也是司法统计和监督的重要依据。通过对撤诉案件的存档和分析，法院可以了解案件的处理情况，总结经验教训，提高审判质量，促进司法公正。
存档的内容
民事撤诉案件的存档内容通常包括：
- 起诉状及副本：原告提交的起诉状及其副本，这是案件起诉的原始文件。
- 证据材料：原告提交的证据材料，如合同、协议、收据等，这些材料是证明案件事实的重要依据。
- 撤诉申请书：原告提交的撤诉申请书，这是撤诉行为的正式文件。
- 裁定书：法院作出的准予撤诉的裁定书，这是法院对撤诉申请的正式回应。
- 其他相关材料：如送达回证、庭审笔录（如有）、调解协议（如有）等，这些材料记录了案件处理过程中的重要环节。
存档的流程
整理卷宗：
- 案件承办人员在收到撤诉申请并作出裁定后，会将案件的相关材料进行整理，形成完整的卷宗。这一步骤是确保案件材料完整、有序的重要环节。
归档保存：
- 整理好的卷宗会按照法院的档案管理规定进行归档保存。一般来说，民事案件的诉讼档案会长期保存，以备将来查询和参考。
注意事项
保密性：
- 诉讼档案涉及当事人的隐私和商业秘密，法院会采取必要的保密措施，确保档案信息的安全。这是保护当事人合法权益的重要措施。
查询权限：
- 并非所有人都可以随意查询诉讼档案。根据法律规定，当事人及其诉讼代理人有权依法查阅、复制卷宗材料；其他人员如需查询，需经法院许可并遵守相关规定。这是维护司法秩序和保护当事人隐私的必要措施。
综上所述，民事起诉立案后撤诉，法院会对案件进行存档，这是法律程序的要求，也是保障当事人权益和司法统计与监督的需要。如果你在民事诉讼方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。