总公司是一般纳税人时，分公司可以根据自身经营情况、税务登记及是否满足相关条件，选择作为小规模纳税人或一般纳税人进行税务处理，两者在增值税纳税人身份上相互独立。以下是对此问题的详细分析：

一、总公司与分公司的税务独立性

1. 独立纳税主体：总公司和分公司在税务上被视为两个独立的纳税主体。这意味着，总公司的纳税人类型（一般纳税人或小规模纳税人）并不会直接影响分公司的纳税人类型判定。
2. 独立税务登记：分公司需要独立进行税务登记，并根据其自身的经营情况和税务登记来确定纳税人身份。

二、分公司作为小规模纳税人的条件

1. 年应税销售额标准：分公司如果年应征增值税销售额未超过500万元（此标准可能会根据政策有所调整，具体以最新规定为准），则有可能符合小规模纳税人的条件。
2. 会计核算与税务资料：分公司需要会计核算健全，能够按规定报送有关税务资料。若会计核算不健全，不能提供准确税务资料，则可能影响其作为小规模纳税人的资格。
3. 选择权：即使分公司符合小规模纳税人的标准，它也有权选择是否按小规模纳税人纳税。这取决于分公司的实际经营需要和税务策略。

三、分公司作为一般纳税人的条件

1. 年应征增值税销售额：若分公司年应征增值税销售额超过500万元，且会计核算健全、能够按规定报送税务资料，即可申请成为一般纳税人。
2. 主动申请：即使分公司年应税销售额未超过500万元，只要其会计核算健全、有固定的生产经营场所并能提供准确税务资料，也可主动向主管税务机关办理一般纳税人登记。

四、特殊情况说明

1. 异地分支机构：如果分公司是总公司在异地设立的分支机构，并且不向当地独立缴纳企业所得税，而是由总公司汇总缴纳，那么这种情况下，分公司通常不会被认定为一般纳税人（在所得税方面），而是会跟随总公司的纳税方式进行税务处理。但这并不影响其在增值税方面的独立纳税人身份认定。
2. 税务负担与经营管理影响：选择作为小规模纳税人还是一般纳税人，对分公司的税务负担和经营管理都会产生重要影响。因此，在做出决定之前，分公司应仔细评估各种因素，包括业务规模、客户群体、税收政策等，以确保做出最合理的选择。

五、建议与注意事项

• 密切关注税收法规变化：税收法规和政策可能随时间变化，分公司应定期关注税务机关发布的最新通知和公告，以确保合规。
• 寻求专业税务建议：在具体的税务问题上，分公司应咨询当地的税务机关或专业的税务顾问，以确保准确理解和遵守税法规定。
• 合规性：对于总公司与分公司之间的税务关系，特别是涉及汇总纳税的情况，应特别注意销售额的计算和税务处理的合规性。

综上所述，总公司是一般纳税人时，分公司可以根据自身情况选择作为小规模纳税人或一般纳税人。这一选择应基于分公司的实际经营需要、税务登记情况以及相关政策规定来综合考虑。如有任何疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。