村委会在特定且合法的情形下，确实有权收回有集体土地使用证的牧业小区土地，但必须严格遵循法定程序，并确保被收回土地者的合法权益得到合理补偿和安置。以下是对这一问题的详细分析：
一、合法收回的情形
公共设施和公益事业建设需要：
- 如果牧业小区的土地需要被用于修建村里的道路、广场、养老院等公共设施或公益事业项目，且经过法定审批程序，村委会可以收回土地。这种情况下，收回土地是为了满足公共利益的需要，确保村集体土地的合理利用和规划实施。同时，应对原土地使用者给予适当补偿，以保障其合法权益。
不按照批准的用途使用土地：
- 如果牧业小区的土地使用者擅自改变土地用途，例如将原本用于牧业的土地用于非农业用途，且未办理合法审批手续，村委会有权报经批准后收回该土地。这是为了确保土地使用符合规划和规定，保护村集体土地资源不被滥用。
因撤销、迁移等原因而停止使用土地：
- 如果牧业小区因企业倒闭、村民搬迁等原因导致土地闲置且不再使用，村委会有权收回土地以避免土地资源的浪费。这种情况下，收回土地是为了保证土地的有效利用。
土地使用期限届满：
- 如果牧业小区的土地是通过租赁、承包等方式获得的，且使用权期限已届满，村委会有权收回土地。这是基于合同约定的使用权期限，确保土地使用的有序性。
二、收回程序要求
提出申请：
- 村委会需要向相关土地管理部门提出收回土地的申请，并详细说明收回原因、范围等。
审核与审批：
- 土地管理部门会对申请进行审核，并按规定进行审批，以确保收回行为的合法性。
发布公告：
- 在村里显著位置发布公告，告知村民收回土地的相关事宜，保障村民的知情权。
补偿安置：
- 如果涉及对土地使用者的补偿，应按照规定进行合理补偿和妥善安置，确保被收回土地者的合法权益。
办理土地变更登记手续：
- 收回土地后，需到土地管理部门办理土地变更登记，明确土地权属状态。
三、未经合法程序收回的无效性
- 如果村委会未经合法程序随意收回土地，该行为是违法且无效的。土地使用者有权通过法律途径维护自己的权益，包括向相关部门反映要求纠正违法行为，或直接向人民法院提起诉讼，请求确认收回行为违法，并要求恢复对土地的合法使用权益。
四、实际建议
- 了解收回原因：如果您的牧业小区土地面临被收回的情况，首先应了解收回的具体原因和依据。
- 核实程序合法性：确认村委会是否按照法定程序进行收回，包括是否提出申请、是否经过审核与审批、是否发布公告等。
- 寻求合理补偿：如果收回土地涉及补偿问题，应确保补偿方案合理且符合法律法规规定。
- 维护合法权益：如果认为村委会的收回行为违法或侵犯了自己的合法权益，可以通过法律途径进行维权。
总结来说，村委会在特定且合法的情形下有权收回有集体土地使用证的牧业小区土地，但必须严格遵循法定程序并确保被收回土地者的合法权益得到合理补偿和安置。如果您面临此类问题或有任何疑问，请直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。