农村集体合作社董事长是否可以在承包人那里入股，需分情况讨论，核心在于是否符合法律规定及程序要求，具体如下：

1. 若董事长以个人身份入股，且符合法定程序与条件
   根据《农村土地承包法》及《公司法》相关规定，若承包人系依法承包农村土地的自然人、法人或其他组织，且其承包经营权未受限制（如未被抵押、未涉及纠纷等），董事长作为自然人，可以个人名义与承包人协商入股。此时需满足：

   • 程序合法：双方需签订书面入股协议，明确股权比例、分红方式、权利义务等，并依法办理工商登记（若承包人设立公司）或备案手续（如合作社内部协议）。
     
   • 内容合法：入股不得改变土地农业用途（如将耕地转为建设用地），不得损害集体或其他成员利益，且需符合合作社章程或承包合同约定。
     
   • 无利益冲突：若董事长同时担任合作社职务，需确保入股行为未利用职务便利谋取私利，避免违反《村民委员会组织法》或合作社内部廉洁规定。

2. 若董事长以合作社名义入股，则需严格限制
   农村集体合作社作为集体经济组织，其资产属于全体成员共有。若董事长拟以合作社名义入股承包人，必须满足：

   • 成员大会决议：根据《农民专业合作社法》，涉及重大资产处置（如入股、投资）需经成员大会三分之二以上表决权通过，并形成书面决议。
     
   • 用途合规：入股资金或资产需用于合作社生产经营，且不得损害成员利益。例如，若合作社以土地经营权入股，需确保承包人按约定使用土地，并定期向成员公开收益分配情况。
     
   • 避免关联交易：若董事长与承包人存在关联关系（如亲属、控股关系），需提前披露并回避表决，防止利益输送。

3. 需警惕的违法情形

   • 以权谋私：若董事长利用职务便利，强制要求承包人接受其入股，或以入股为条件谋取其他利益，可能构成职务侵占或受贿，需承担刑事责任。
     
   • 非法转让土地：若入股实质是变相转让土地承包经营权（如将耕地转为非农用途），可能违反《土地管理法》，导致合同无效并面临行政处罚。
     
   • 未履行民主程序：若合作社入股未经成员大会决议，或董事长个人入股未公开披露，可能引发成员诉讼，要求撤销入股行为或赔偿损失。

建议：若您或合作社拟进行此类操作，建议提前审查承包合同、合作社章程，并咨询律师制定合规方案，确保程序与实体均合法。如有具体案例或合同文本，可进一步向我提供细节，我会为您分析风险点。