工程款抵押公证合同在符合法定条件时是有效的。以下从多个角度为你详细分析：

一、合同有效的基本条件

根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，一个合同要有效，通常需要满足以下几个基本条件：

1. 双方当事人具有相应的民事行为能力：即签订合同的双方都应当是具有完全民事行为能力的自然人、法人或其他组织。
2. 意思表示真实：合同内容应当是双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
3. 不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗：合同内容应当合法，不得违反国家法律法规的强制性规定，也不得违背社会公德和公共秩序。

在工程款抵押公证合同的情境中，只要合同双方满足上述条件，且合同内容合法合规，那么该合同就是有效的。

二、公证的作用

公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。在工程款抵押公证合同中，公证的作用主要体现在以下几个方面：

1. 增强合同的证明力：经过公证的合同，其真实性、合法性得到了公证机构的确认，因此在法律上具有更强的证明力。
2. 预防纠纷：公证过程本身就是一个对合同内容进行审查的过程，可以及时发现并纠正合同中的瑕疵或问题，从而预防未来可能出现的纠纷。
3. 便于执行：如果合同双方发生纠纷并诉诸法律，经过公证的合同往往更容易被法院采纳作为证据，从而便于判决的执行。

三、工程款抵押的特殊性

工程款抵押作为一种特殊的抵押方式，其有效性还受到一些特殊规定的约束。例如，根据相关法律法规的规定，工程款抵押应当办理抵押登记手续，否则抵押权不得对抗善意第三人。因此，在签订工程款抵押公证合同时，除了满足上述合同有效的基本条件外，还需要确保已经按照法律规定办理了抵押登记手续。

四、可能影响合同效力的因素

尽管工程款抵押公证合同在符合法定条件时是有效的，但仍然存在一些可能影响合同效力的因素，包括但不限于：

1. 抵押物是否存在瑕疵：如果抵押物存在权属争议、被查封、扣押等情形，可能会影响抵押权的设立和行使。
2. 合同内容是否明确具体：合同内容应当明确具体，包括抵押物的描述、抵押担保的范围、抵押权的实现方式等。如果合同内容模糊不清或存在歧义，可能会导致合同无效或无法履行。
3. 是否存在违反法律、行政法规的强制性规定：如果合同内容违反了国家法律法规的强制性规定，如禁止抵押的财产范围等，那么该合同将是无效的。

五、建议

为了确保工程款抵押公证合同的有效性，我建议你：

1. 在签订合同前仔细审查合同内容：确保合同内容合法合规、明确具体，不存在模糊不清或歧义的情况。
2. 及时办理抵押登记手续：按照法律规定办理抵押登记手续，确保抵押权的设立和行使。
3. 咨询专业律师：在签订合同前或合同履行过程中遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。

综上所述，工程款抵押公证合同在符合法定条件时是有效的。但为了确保合同的有效性和顺利履行，建议你仔细审查合同内容、及时办理抵押登记手续，并在必要时咨询专业律师。