在劳动仲裁中，仲裁赔偿金（经济补偿金）是按照应发工资来计算的。以下是对此问题的详细分析：
一、应发工资与实发工资的界定
- 应发工资：指员工在工作期间应得的全部报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等货币性收入，但不包含个人所得税、社会保险等扣除项。这是劳动者提供正常劳动后，依法应当获得的工资总额。
- 实发工资：是员工实际收到的工资，已扣除了个人所得税、社会保险费等费用。
二、法律依据
- 根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条，劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条也明确规定了经济补偿的计算标准，其中涉及的“月工资”同样指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，即应发工资。
三、经济补偿金的具体计算方式
- 计算基数：以劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资为基数，这里的“工资”特指应发工资。
- 计算标准：
- 每满一年支付一个月工资的经济补偿；
- 六个月以上不满一年的，按一年计算；
- 不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿；
- 若劳动者月工资高于所在地区上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿金的标准按该三倍数额支付，且最高支付年限不超过十二年。
计算公式（以常规情况为例）：
经济补偿金 = 工作年限 × 劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资（应发工资）
四、特殊情况处理
在某些特殊情况下，如劳动者工资存在不固定、不确定的情况，或用人单位故意压低、抬高工资以影响经济补偿金计算时，仲裁机构或法院会综合考虑各种因素，合理确定经济补偿金的计算基数。此外，如果劳动合同或集体合同中有明确且不违法的工资计算约定，也可按约定执行。
五、实际建议
- 保留证据：劳动者在申请劳动仲裁时，应保留好与工资相关的证据，如工资条、银行流水等，以证明自己的应发工资水平。
- 咨询专业意见：如果对经济补偿金的计算有疑问或争议，建议及时咨询专业律师，以确保自己的权益得到充分保障。
综上所述，劳动仲裁中的经济补偿金计算基数为应发工资，这一规定旨在更准确地反映劳动者因劳动争议所遭受的实际经济损失，从而充分保障劳动者的合法权益。在实际操作中，应严格按照法律法规执行，确保经济补偿金的计算公正、合理。如果您在劳动仲裁过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。