结论：企业贷款时，持股0.1%的股东是否需要签字，需结合企业类型、贷款性质及公司章程综合判断，具体分析如下：

1. 有限责任公司

   • 一般情况：根据《公司法》第十六条，公司为他人提供担保或向其他企业投资，需经董事会或股东会决议。若贷款属于公司自身经营性融资（非为他人担保），通常无需股东签字，但需按章程规定履行内部决策程序（如股东会决议）。
     
   • 例外情形：若公司章程明确规定“所有股东需对贷款事项签字确认”，或贷款协议中约定需全体股东签字（如涉及连带责任担保），则持股0.1%的股东亦需签字。
     
   • 实践建议：查阅公司章程及贷款协议条款，确认是否有特殊约定；若无，则按法定程序决策即可。

2. 股份有限公司

   • 一般情况：股份有限公司决策权集中于董事会或股东大会，小额贷款通常由董事会决议，大额贷款需股东大会批准，但无需单个股东签字（除非章程另有规定）。
     
   • 例外情形：若股东为贷款提供个人连带责任保证，则需该股东单独签署保证合同，此时与持股比例无关，0.1%股东亦需签字。
     
   • 实践建议：区分公司决策与个人担保责任，若仅作为股东参与决策，无需签字；若提供个人担保，则必须签字。

3. 其他关键因素

   • 贷款性质：若贷款涉及公司重大资产抵押或关联交易，可能触发更严格的决策程序（如需全体股东同意），此时0.1%股东可能需签字。
     
   • 银行要求：部分银行为控制风险，可能要求所有股东签署《股东承诺书》或类似文件，此时需配合签字。
     
   • 章程优先：若公司章程对贷款决策程序有特殊规定（如“需全体股东签字”），则以章程为准，无论持股比例高低。

总结：持股比例本身非决定性因素，需结合企业类型、贷款性质、章程规定及银行要求综合判断。建议优先查阅公司章程及贷款协议，明确各方权利义务；若涉及个人担保或特殊决策程序，则需按要求签字。如有进一步疑问，可直接向我咨询企业法律事务。