违反《中华人民共和国道路交通安全法》第四十九条（即机动车载人不得超过核定的人数，客运机动车不得违反规定载货）是否扣分，需根据具体违法情形来确定。以下是对此问题的详细分析：

1. 超员违法情形：

   • 若驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车载人超过核定人数未达20%的，根据相关交通法规，一般会面临罚款并记分的处罚。具体记分分值可能因地区和具体法规版本而有所不同，但通常此类违法行为会记一定分数（如6分，具体以最新法规为准）。
   • 若驾驶营运客车（不包括公共汽车）、校车以外的载客汽车载人超过核定人数20%以上的，同样会面临罚款和记分的处罚，且记分分值可能更高（如也是6分或更多，具体依据最新法规）。

2. 客运机动车违反规定载货：

   • 如果客运机动车违反规定载货，即违反了交法第四十九条中“客运机动车不得违反规定载货”的规定，这种违法行为通常也会面临罚款，但关于是否直接扣分，可能因具体地区和执法实践而有所不同。不过，从广义上讲，任何违反交通法规的行为，如果情节严重或构成安全隐患，都有可能被记分，只是具体记分标准需参照当地交通法规。

3. 综合考量：

   • 实际上，交通违法行为的记分处理往往与违法行为的性质、情节以及可能造成的后果紧密相关。因此，对于违反交法第四十九条的具体记分情况，还需结合当地交通法规、执法实践以及违法行为的实际情况来综合判断。
   • 此外，值得注意的是，交通法规会随着时间和社会的变化而不断更新和完善。因此，在处理具体交通违法行为时，应参照最新的交通法规和执法标准。

建议：

• 为了准确了解违反交法第四十九条是否扣分以及扣分的具体分值，建议查阅当地最新的交通法规或咨询当地交通管理部门。
• 驾驶员在驾驶过程中应严格遵守交通法规，确保行车安全，避免因违法行为而面临罚款、记分等处罚。

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