违反《道路交通安全法》第49条是否会扣分，需结合具体违法行为及地方规定判断，但通常涉及机动车载人超员时会扣分。以下从法律条款、常见情形及地方差异三个角度详细说明：

1. 法律条款核心内容

《道路交通安全法》第49条规定：“机动车载人不得超过核定的人数，客运机动车不得违反规定载货。”
该条款明确禁止两类行为：

• 超员：如5座车坐6人（含儿童）；
  
• 客货混装：如用客车车厢装载大量货物。
  若违反，属于交通违法行为，可能面临扣分、罚款等处罚。

2. 常见扣分情形

根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》（公安部令第163号），以下行为会扣分：

• 驾驶7座以上载客汽车超员50%以上未达100%：扣9分（如9座车坐14人）；
  
• 驾驶其他载客汽车超员50%以上未达100%：扣6分（如5座车坐8人）；
  
• 驾驶校车、公路客运汽车、旅游客运汽车超员未达20%：扣6分；
  
• 驾驶其他载客汽车超员20%以上未达50%：扣3分（如5座车坐6-7人）。
  若仅超员20%以下（如5座车坐6人），部分地区可能仅罚款不扣分，但需以地方规定为准。

3. 地方规定差异

部分省份对超员处罚有细化规定，例如：

• 广东省：对5座车超员1人（20%以下），罚款200元、不扣分；超员2人（20%-50%），罚款200元、扣3分。
  
• 北京市：对客货混装行为，罚款200元、不扣分，但需立即整改。
  建议通过当地交警部门官网或APP查询具体处罚标准。

4. 其他法律后果

除扣分外，违反第49条还可能面临：

• 罚款：通常200-500元（具体金额因违法行为而异）；
  
• 暂扣车辆：如客货混装严重危及安全；
  
• 事故责任加重：若因超员导致事故，可能承担更高比例赔偿责任。

5. 温馨提示

• 儿童也算载客人数：即使婴儿也需计入核载人数；
  
• 避免侥幸心理：超员会降低车辆操控性，增加事故风险；
  
• 定期检查车辆：确保不因改装（如拆除座椅）导致违法。
  

如有具体违法行为或地方处罚疑问，可直接向我咨询，我会结合案情和地方规定为您详细解答。