当您起诉公司后却发现其账户没有钱时，确实会面临一些挑战，但您仍然有多种途径可以尝试来维护自己的合法权益。以下是一些详细且具有深度的建议：
一、深入调查公司财务状况
申请财产保全与调查令：
- 在诉讼前或诉讼过程中，您可以向法院申请财产保全，以防止公司转移或隐匿财产。
- 同时，申请调查令，全面调查公司的银行账户、财务报表、交易记录等，以确定其真实的财务状况。这包括关注公司的固定资产、知识产权、对外投资及应收账款等隐蔽财产线索。
利用执行查控系统：
- 在诉讼结束后，如果公司仍未履行义务，您可以向法院申请执行，并利用全国法院网络执行查控系统，对公司的银行存款、不动产、车辆等进行全面查询和控制。
二、追加相关责任主体
股东责任：
- 如果公司股东存在未足额出资、抽逃出资或滥用公司法人独立地位等行为，您可以依法追加其为被执行人，要求其在相应范围内承担清偿责任。
关联公司与实际控制人责任：
- 对于与公司存在人格混同的关联公司或操纵公司逃避债务的实际控制人，您同样有权追究其连带责任。
三、采取法律执行措施
强制执行现有财产：
- 依据《中华人民共和国民事诉讼法》，您可以向法院申请对公司现有的办公设备、库存商品等财产进行查封、扣押、拍卖，以实现债权。
参与公司破产程序：
- 如果公司确实资不抵债，您可以向法院申请对公司进行破产清算或重整。在破产程序中，您将按照法定顺序参与公司财产的分配。
限制高消费与列入失信名单：
- 申请法院对被执行人采取限制高消费措施，限制其乘坐飞机、高铁等高档出行方式，以及入住星级酒店等高消费行为。
- 若被执行人拒不履行义务，可将其纳入失信被执行人名单，通过信用惩戒机制迫使其履行义务。
强制审计与搜查：
- 申请法院对被执行人进行强制审计，查明其真实的财务状况和资金流向。
- 在必要时，法院可对被执行人的住所或经营场所进行搜查，查找并扣押有价值的财产。
四、寻求替代性解决方案
协商和解：
- 与公司进行协商，尝试达成和解协议，制定分期还款计划或其他可行的解决方案。这可能是一个高效且灵活的解决方式，有助于双方避免进一步的法律纠纷。
以物抵债：
- 经双方同意，您可以通过以物抵债的方式实现债权，即用公司的实物资产折抵债务。这可以是一种快速且有效的解决方式，特别是当公司确实没有现金但拥有有价值的资产时。
债权转让：
- 如果您认为继续追偿的难度较大或成本较高，您可以考虑将债权转让给第三方，由第三方继续向公司追偿。这可以帮助您快速回收部分资金，并减少后续的法律纠纷。
五、寻求专业法律帮助
在处理此类复杂纠纷时，咨询专业律师的意见至关重要。律师能够根据公司具体情况提供法律建议，协助制定解决方案，并代表您参与协商、诉讼等法律程序。他们可以帮助您更全面地了解相关法律法规和程序要求，确保您的权益得到合法且最大化的保护。
综上所述，当起诉公司后发现其账户没有钱时，您应综合运用多种手段来维护自身权益。通过深入调查公司财务状况、追加相关责任主体、采取法律执行措施以及寻求替代性解决方案等方式，您有望最大程度地挽回损失并保障自身合法权益。