关于违反交通信号灯扣6分后，记分何时归位的问题，结论如下：
记分周期与归位时间：
- 根据《机动车驾驶证申领和使用规定》，记分周期为12个月，从机动车驾驶证初次领取之日起计算。
- 若您在一个记分周期内因违反交通信号灯被扣6分，这6分将记录在该周期内。当该记分周期结束时，即满12个月后，这6分将自动清除，记分归位。
记分处理与影响：
- 您已经处理了罚款，这是遵守交通法规的重要一步。罚款的缴纳与记分的清除是两个独立的过程，罚款的缴纳不会直接影响记分的清除时间。
- 记分未清除前，若您再次违反交通法规并达到或超过12分，将面临驾驶证被暂扣、需要参加交通安全法律、法规学习并接受考试等后果。
特殊情况说明：
- 如果您在一个记分周期内累积记分达到12分，除了需要参加学习和考试外，还可能面临驾驶证被降级、注销等更严重的后果。
- 若您对记分有异议，可以在收到处罚决定书之日起60日内向作出处罚决定的机关的上一级机关申请行政复议，或者在6个月内直接向人民法院提起行政诉讼。
建议与提醒：
- 为了避免记分累积和可能的法律后果，建议您严格遵守交通法规，特别是交通信号灯的规定。
- 定期查询自己的驾驶证记分情况，以便及时了解并处理任何记分问题。
- 如果您对交通法规或记分处理有任何疑问，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律解答。
示例说明：
假设您的驾驶证初次领取日期是2023年1月1日，那么您的记分周期就是每年的1月1日至12月31日。如果您在2023年5月因违反交通信号灯被扣6分，那么这6分将记录在2023年的记分周期内。当2023年12月31日记分周期结束时，这6分将自动清除，您的记分将归位。