股东在行使查账权时，可通过以下方式合法搜集证据，以保障自身权益并确保程序合规：

1. 明确查账权的法律依据与范围
   根据《公司法》第三十三条，股东有权查阅、复制公司章程、股东会会议记录、董事会会议决议、监事会会议决议和财务会计报告，并可要求查阅公司会计账簿（需书面说明目的）。证据搜集的第一步是确认自身权利范围，避免因越权主张导致证据无效。例如，若股东仅要求查阅会计账簿，需明确区分其与原始凭证的界限（司法实践中对原始凭证的查阅权存在争议，需结合具体案情判断）。

2. 书面提出查账请求并留存送达证据
   股东应向公司提交书面申请，明确查阅目的（如“了解公司经营状况、核实财务数据真实性”等），并要求公司书面答复。送达证据是关键，建议通过EMS邮寄（备注文件名称）或电子邮件（使用公司注册邮箱）发送，并保留寄送凭证或发送记录。若公司拒绝或未答复，此书面请求可作为后续诉讼的证据。

3. 查阅过程中制作详细记录并固定证据
   在查阅会计账簿时，股东可对关键数据、异常交易、关联方往来等事项进行记录，并要求公司盖章确认记录内容的真实性。若公司拒绝盖章，股东可邀请第三方（如公证处）现场见证，或通过录音、录像等方式固定证据。注意：查阅范围仅限法定内容，不得擅自复制或带走账簿，否则可能构成侵权。

4. 针对公司拒绝查账的合法性进行举证
   若公司以“不正当目的”为由拒绝查账，股东需反驳该主张。例如：

   • 若公司称股东查阅账簿是为了损害公司利益，股东可提供证据证明自身无恶意（如未参与同业竞争、未泄露公司机密等）；
     
   • 若公司拒绝提供账簿但未说明理由，股东可主张公司行为违法，并要求法院强制查阅。
     关键点：股东需证明自身目的合法且与公司利益一致，而公司需承担“不正当目的”的举证责任。

5. 利用司法程序强化证据效力
   若协商无果，股东可向法院提起“股东知情权之诉”，要求公司提供账簿查阅。在诉讼中，股东需提交以下证据：

   • 股东身份证明（如工商登记信息、股权协议）；
     
   • 书面查账申请及送达证据；
     
   • 公司拒绝或未答复的证据；
     
   • 查阅目的合法性的说明（如公司经营异常、关联交易存疑等）。
     提示：法院判决后，股东可依据生效文书申请强制执行，由法院指定第三方机构协助查阅。

总结：股东查账的证据搜集需围绕“权利合法性、程序合规性、目的正当性”展开，通过书面申请、过程记录、司法举证等环节形成完整证据链。若遇复杂情况（如公司拒不配合、账簿不完整），建议直接向我咨询，我将结合具体案情提供针对性方案。