可以打电话询问，且这是合理且必要的做法。以下是详细说明：
- 从法律程序的角度：申请抚养费强制执行后，法院有义务在法定期限内采取执行措施。如果三个月都没有执行，这可能超出了正常的执行周期（虽然不同地区、不同案件情况执行周期会有所不同，但三个月未执行往往需要进一步了解原因）。此时打电话询问法院执行部门，能够直接了解到案件的执行进展情况，比如是否已经立案、是否在查找被执行人的财产线索、是否遇到了阻碍执行的特殊情况等。通过询问，你可以明确下一步该如何配合法院的执行工作，或者是否需要采取其他法律手段来推动执行进程。
- 从维护自身权益的角度：抚养费关系到被抚养人的切身利益，作为申请执行人，你有权利及时知晓案件的执行动态。打电话询问是一种直接、有效的沟通方式，能够让你及时掌握情况，避免因为信息不畅而导致自身权益受损。如果发现法院存在执行不力的情况，你还可以根据具体情况，向上级法院反映或者采取其他合法途径来维护自己的权益。
在打电话询问时，你可以注意以下几点：
- 准备好相关信息：在拨打电话前，准备好案件的案号、申请执行的时间、被执行人的基本信息等，这样能够方便法院工作人员快速查询案件情况，提高沟通效率。
- 注意沟通方式：与法院工作人员沟通时，要保持礼貌和耐心，清晰地表达自己的疑问和诉求。避免使用过激或者不恰当的语言，以免影响沟通效果。
- 记录沟通内容：在通话过程中，可以记录下法院工作人员的答复和建议，以便后续参考和跟进。
如果打电话询问后，你对法院的答复仍然存在疑问或者不满意，还可以考虑亲自前往法院执行部门，与工作人员当面沟通，进一步了解案件情况。