结论：农民合作社在立案之前把钱还了，是否还会追究责任，这取决于多个因素，包括还款的完整性、是否存在其他违法行为以及法律程序的进展等。以下是对这一问题的详细分析：

1. 还款的完整性：

   • 如果农民合作社在立案之前已经全额偿还了所有欠款，且没有其他违法行为，那么从一般意义上讲，其法律责任可能会得到减轻或免除。因为还款行为本身表明了合作社愿意履行其法律义务，并纠正了之前的错误。
   • 然而，如果还款并不完整，或者存在欺诈、隐瞒等违法行为，那么即使部分还款，合作社仍可能面临法律责任。

2. 是否存在其他违法行为：

   • 除了欠款问题外，如果农民合作社还存在其他违法行为，如非法集资、诈骗等，那么即使欠款已经还清，合作社仍可能因这些违法行为而受到法律追究。
   • 法律责任的追究不仅限于经济纠纷，还包括对合作社整体运营合法性的审查。

3. 法律程序的进展：

   • 如果立案程序已经启动，即使合作社在立案前还款，法律程序仍可能继续进行，以审查合作社的还款行为是否合法、是否存在其他违法行为等。
   • 在某些情况下，即使欠款已经还清，法院或相关机构仍可能对合作社进行处罚，如罚款、吊销营业执照等，以维护法律秩序和公平正义。

4. 法律后果的多样性：

   • 农民合作社在立案前还款，其法律后果可能因具体情况而异。如果还款行为被认定为真诚且合法，合作社可能仅面临轻微的处罚或警告。
   • 如果还款行为存在瑕疵或合作社存在其他违法行为，那么合作社可能面临更严重的法律后果，包括刑事责任、民事责任以及行政责任等。

建议：

• 对于农民合作社而言，如果面临法律纠纷或欠款问题，应尽早与债权人协商还款事宜，并确保还款行为的合法性和完整性。
• 同时，合作社应加强内部管理，遵守法律法规，避免涉及其他违法行为，以降低法律风险。
• 如果已经面临立案程序，合作社应积极配合法律程序，如实陈述事实，提供相关证据，以维护自身合法权益。

进一步思考：

• 农民合作社在运营过程中应建立健全的财务管理制度，确保资金使用的透明度和合法性。
• 在涉及经济纠纷时，合作社应寻求专业法律人士的帮助，以制定合理的还款计划和法律策略。

如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。