结论前置：药品无照经营两年后停止经营，药监局仍可能依据既往违法行为进行处罚，但具体处罚方式需结合违法行为终止时间、是否被查处等因素综合判断。以下分情况说明：

1. 若违法行为在两年内未被发现，可能面临行政处罚时效问题

根据《行政处罚法》第三十六条，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（涉及公民生命健康安全且有危害后果的，时效延长至五年）。

• 关键点：
  
  • 若无照经营行为在两年内未被药监局立案或调查，且未造成严重后果（如假药、劣药导致人身损害），可能因超过处罚时效而免于行政处罚。
    
  • 但若违法行为持续至两年内（例如经营行为在两年内未完全停止），或药监局在两年内已立案调查，则不受时效限制，仍可处罚。

2. 若违法行为在两年内被发现，处罚不因停止经营而免除

即使经营者已停止经营，药监局仍可对既往违法行为进行处罚，常见措施包括：

• 没收违法所得：若经营期间有盈利，需全部没收。
  
• 罚款：根据《药品管理法》第一百一十五条，无证经营药品的，处违法经营的药品货值金额十五倍以上三十倍以下罚款；货值金额不足十万元的，按十万元计算（即最低罚款150万元）。
  
• 其他处罚：如责令关闭、没收用于违法经营的工具设备等。
  
• 信用惩戒：违法行为可能被记入信用记录，影响未来经营资质申请。

3. 特殊情形：构成犯罪的，追究刑事责任

若无照经营药品涉及生产、销售假药/劣药，或造成严重后果（如人员伤亡），可能触犯《刑法》第一百四十一条（生产、销售假药罪）或第一百四十二条（生产、销售劣药罪），面临有期徒刑、罚金甚至死刑的刑事处罚。刑事责任不受行政处罚时效限制，即使停止经营多年仍可能被追诉。

4. 建议：主动配合调查，争取从轻处理

若药监局已介入调查，建议：

• 立即停止一切与药品相关的活动；
  
• 配合提供经营记录、财务凭证等证据；
  
• 积极整改（如申请药品经营许可证），争取从轻或减轻处罚。
  

温馨提示：药品经营涉及公共安全，法律对无证经营处罚严厉。若您或他人涉及此类问题，可直接向我咨询具体应对方案，我会结合细节提供专业建议。