医生使用抗生素引起菌群失调，患者是可以追责的，但具体能否成功追责以及追责的程度，需根据具体情况来判断。以下从几个关键角度进行分析：

1. 医疗过错与因果关系：

   • 根据《民法典》第一千二百一十八条，患者在诊疗活动中受到损害，若医疗机构或其医务人员存在过错，且该过错与患者的损害结果之间存在因果关系，则医疗机构应承担赔偿责任。
   • 在此案例中，若医生在使用抗生素时未遵循诊疗规范，如未进行必要的药敏试验、未根据患者情况调整剂量或未告知患者可能的副作用等，导致患者菌群失调，那么医生的行为可能构成医疗过错。
   • 患者需证明菌群失调是由医生使用抗生素的行为直接导致的，即存在因果关系。这通常需要专业的医疗鉴定来确认。

2. 举证责任：

   • 在医疗损害责任纠纷中，患者通常承担举证责任，需证明医疗行为存在过错、患者有损害以及医疗过错与损害结果之间存在因果关系。
   • 若患者无法直接证明这些要素，但依法提出医疗损害鉴定申请的，人民法院应予准许。通过鉴定，可以更科学地确定医疗行为与损害结果之间的关系。

3. 可能的法律后果：

   • 若经鉴定确认医生存在医疗过错，且该过错与患者的菌群失调之间存在因果关系，那么医疗机构应承担相应的赔偿责任。
   • 赔偿范围可能包括患者因菌群失调而产生的医疗费用、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用，以及因误工减少的收入等。

4. 特殊情况考量：

   • 若医生在使用抗生素时已遵循诊疗规范，且菌群失调是由于患者个体差异、病情发展或其他不可抗力因素导致的，那么医生可能不承担赔偿责任。
   • 另外，若患者在接受治疗过程中未遵循医嘱，如自行增减药量、未按时服药等，导致菌群失调，那么患者自身也可能需承担一定责任。

建议：

• 若您或您身边的人因医生使用抗生素导致菌群失调，并认为医生存在过错，建议首先收集相关证据，如病历、处方、检查报告等。
• 及时咨询专业医疗鉴定机构，对医疗行为与损害结果之间的关系进行鉴定。
• 根据鉴定结果，若确认医生存在过错，可向医疗机构提出赔偿要求，或通过法律途径维护自身权益。

在处理此类医疗纠纷时，务必保持冷静和理性，通过合法途径维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。