在解答您的问题“银行贷款要签免税协议吗”之前，我们需要明确一点：银行贷款本身并不直接涉及签订免税协议这一环节。不过，根据您提供的参考信息，我可以为您详细解释一下与银行贷款相关的免税政策，以及这些政策如何可能影响到您。

首先，关于金融机构农户贷款利息收入免征增值税的政策，这是国家为了支持农业发展和小微企业融资而出台的一项税收优惠政策。具体来说，如果金融机构向符合条件的农户发放小额贷款，并取得的利息收入，在符合一定条件下是可以免征增值税的。这里的“符合条件”主要指的是农户的定义以及小额贷款的标准，如参考信息中所述，农户是指长期居住在乡镇行政管理区域内的住户等，小额贷款则是指单户授信小于100万元（含本数）的贷款。

然而，这一免税政策并不意味着借款人在申请贷款时需要与银行签订免税协议。实际上，免税政策的享受是金融机构的责任和义务，金融机构需要根据相关政策规定，将符合免税条件的小额贷款利息收入单独核算，并向主管税务机关办理纳税申报。对于借款人来说，他们只需要按照正常的贷款流程申请贷款，并按照合同约定还款即可。

另外，关于金融机构向小微企业、个体工商户发放小额贷款的免税政策，也是类似的。金融机构在发放贷款时，会根据借款人的身份（是否为小微企业或个体工商户）以及贷款金额（是否为小额贷款）来判断是否符合免税条件，并据此进行税务处理。

综上所述，银行贷款本身并不需要签订免税协议。免税政策的享受是金融机构根据国家税收政策规定自行判断和处理的。如果您在申请银行贷款时有关于免税政策的疑问或需要了解更多信息，建议您直接咨询贷款银行或相关税务部门，以获取最准确和权威的解答。