工程劳务款并不能简单地等同于农民工工资，这两者在定义、涵盖范围、支付方式、税务处理以及法律适用等多个方面都存在显著差异。

首先，从定义上来看，农民工工资是农民工为用人单位提供劳动后应获得的劳动报酬，它基于劳动合同产生，是用人单位必须依法支付的报酬，与农民工之间存在明确的雇佣关系。而工程劳务款则是在工程建设等相关活动中，为提供劳务所支付的费用，它基于承揽合同、技术合同等产生，涉及劳务成果的交付和对应报酬的支付。

其次，在涵盖范围上，农民工工资主要是农民工因付出体力劳动而应获得的报酬，它构成了工程劳务款的一部分。但工程劳务款的范畴更为广泛，它不仅包含农民工的报酬，还可能涵盖技术工人、管理人员等其他参与工程劳务活动人员的薪资，以及劳务公司的管理费用、设备材料损耗等相关成本。

再者，从支付方式来看，农民工工资通常通过用人单位的财务系统定期支付，如月薪、季薪等，以确保农民工的稳定收入。而工程劳务款则是在劳务完成后，根据合同约定进行一次性或分期支付，这取决于劳务合同的约定和工程项目的进度。

此外，在税务处理上，农民工工资需要按照国家规定缴纳个人所得税，由用人单位代扣代缴。而工程劳务款则需要按照税法规定缴纳增值税及附加税费，个人所得部分也需缴纳个人所得税，但两者的计税方式和税率可能存在差异。

最后，从法律适用和争议解决的角度来看，农民工工资受《中华人民共和国劳动法》等劳动法律法规的调整和保护，因农民工工资引发的争议通常可以通过劳动仲裁、劳动诉讼等方式解决。而工程劳务款则主要受《中华人民共和国民法典》等民事法律法规的调整，因工程劳务款引发的争议主要通过协商、调解、仲裁或民事诉讼等方式解决。

综上所述，工程劳务款与农民工工资在多个方面都存在显著差异。在实际操作中，我们应明确区分两者，确保各自权益得到妥善保护和处理。对于工程项目中的各方主体而言，理解并遵守相关法律法规，合理支付和处理工程劳务款与农民工工资，是保障项目顺利进行和维护社会稳定的重要基础。