唯一自然人股东在公司注销后，其权利义务的处理需分情况讨论，具体如下：

1. 公司注销前的权利义务承接
   根据《公司法》及相关司法解释，公司注销后，其民事主体资格消灭，但未了结的债权债务需依法清算。若唯一自然人股东作为清算义务人，已依法完成清算程序（包括通知债权人、公告、清理资产等），且公司财产足以清偿债务，则注销后股东原则上不再承担公司原有权利义务。
   例外情形：若股东未履行清算义务（如未通知债权人、隐匿财产等），导致债权人利益受损，股东可能需对公司债务承担连带清偿责任（《公司法司法解释二》第18-20条）。

2. 公司注销后的剩余财产分配
   唯一自然人股东作为公司唯一出资人，在公司清算后若有剩余财产，可依法取得全部剩余资产。但需注意：

   • 若公司存在未清偿债务，剩余财产需优先用于偿债，剩余部分才能分配给股东；
     
   • 分配时需履行税务申报义务（如个人所得税），避免因税务问题引发后续风险。

3. 股东对公司注销后新产生的义务
   公司注销后，股东原则上不对公司存续期间的行为承担责任，但以下情形除外：

   • 恶意注销：若股东通过虚假清算报告、伪造债务清偿证明等手段注销公司，可能被认定为“恶意逃避债务”，需对公司债务承担责任；
     
   • 未履行法定程序：如未依法公告、未成立清算组等，股东可能因程序瑕疵被追责；
     
   • 第三人承诺：若股东在注销时向债权人出具书面承诺（如“自愿承担公司债务”），则需按承诺履行义务。

实务建议：

1. 注销前务必完成合法清算，保留清算报告、债权人通知记录等证据；
   
2. 若公司存在未了结债务，建议与债权人协商达成书面和解协议后再注销；
   
3. 避免以“空壳公司”形式注销，防止被认定为“滥用公司法人独立地位”。
   

如有具体案件细节（如公司债务情况、清算程序等），可进一步向我说明，我会结合实际情况为您分析风险点。