当村委会的土地被个人非法占有时，这是一个涉及村集体权益的严肃问题，需要采取一系列合法且有效的措施来维护权益。以下是我为您详细梳理的处理步骤和建议：

一、明确问题性质与收集证据

1. 确认占用行为：首先，要明确土地被占用的具体情况，包括占用者身份、占用时间、占用面积以及占用用途等。

2. 收集证据：

   • 土地权属证明：如农村土地承包经营权证、土地使用证等，证明土地归村委会所有。
   • 侵占事实证据：包括现场照片、视频、证人证言等，记录占用行为的实际情况。
   • 相关文件和审批手续：如果可能，尝试获取占用者是否拥有合法占用土地的文件或审批手续，以判断其占用行为的合法性。

二、尝试友好协商与基层调解

1. 友好协商：村委会可以派代表与占用者进行友好协商，说明土地的集体属性及其非法占用的法律后果，争取通过协商解决问题，如要求占用者停止侵权、返还土地或支付合理的土地使用费用。

2. 基层调解：若协商无果，可以请求乡镇政府、街道办事处或相关基层调解组织介入，依据法律法规和政策进行调解。调解过程中，要保持冷静和理性，遵循调解组织的安排和建议。

三、采取行政手段

1. 向相关部门反映：将占用情况向当地乡镇政府或县级以上自然资源主管部门报告，请求其依法查处。报告时，应提供详细的占用情况说明和收集到的证据。

2. 配合调查处理：政府部门接到报告后会进行调查核实，村委会应积极配合提供必要证据和信息，以便政府部门依法作出处理决定，如责令占用者退还非法占用的土地、拆除违法建设或处以罚款等。

四、考虑司法手段

1. 民事诉讼：如果行政手段未能有效解决问题，村委会可以向人民法院提起民事诉讼，要求占用者停止侵权、返还土地并赔偿损失。在诉讼过程中，要提交充分的证据支持主张，并遵循法院的审理程序。

2. 追究刑事责任：若占用行为构成犯罪，如非法占用农用地罪，村委会应及时向公安机关报案，依法追究占用者的刑事责任。这需要提供足够的证据证明占用行为的违法性和严重性。

五、其他途径与预防措施

1. 仲裁：如果当事人不愿协商、调解或协商、调解不成，村委会还可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，以解决土地纠纷。仲裁结果具有法律效力，双方应遵守。

2. 加强监管与预防：村委会应加强对土地的日常监管，建立健全的土地管理制度，防止类似事件再次发生。同时，可以加强村民的法律意识教育，提高大家对土地权益的保护意识。

六、注意事项

• 依法维权：在整个处理过程中，村委会应严格遵守法律法规，确保自身行为的合法性。
• 及时行动：一旦发现土地被占用，应立即采取行动，避免损失扩大。
• 保持冷静：在处理过程中，要保持冷静和理性，避免情绪化行为导致问题复杂化。

综上所述，当村委会的土地被个人非法占有时，应综合运用协商、调解、行政手段、司法手段以及其他途径来维护权益。同时，也要加强日常监管和预防措施，确保村集体的土地权益得到有效保护。