该行为不合法，存在多处违反现行法律法规的情形，具体分析如下：

1. 宅基地使用权流转限制
   根据《土地管理法》第六十二条及《民法典》第三百六十三条，宅基地使用权具有严格身份属性，仅限本集体经济组织成员内部流转，且不得单独转让、抵押或用于非农业建设。村委以”入股拍卖”形式将宅基地使用权对外流转40年，实质是变相转让宅基地使用权，违反了”仅限集体成员内部流转”的强制性规定。

2. 期限违法性
   宅基地使用权本身无明确存续期限限制，但若涉及流转需符合法定条件。根据《中央农村工作领导小组办公室农业农村部关于进一步加强农村宅基地管理的通知》等政策文件，即使通过合法途径流转宅基地使用权，其期限也不得超过20年，且不得改变宅基地用途。40年期限明显超出法定上限，属于无效约定。

3. 程序违法性
   根据《村民委员会组织法》第二十四条，涉及村民利益的重大事项（包括宅基地使用方案）需经村民会议或村民代表会议三分之二以上成员同意，并报乡（镇）人民政府批准。若村委未经法定民主议定程序即实施拍卖行为，构成程序违法。

4. 入股形式合法性存疑
   若以宅基地使用权作价入股，需满足《公司法》关于非货币财产出资的条件（可评估、可转让）。但宅基地使用权因身份限制无法自由转让，不符合入股资产的基本要求。此外，集体土地入股需符合《土地管理法》第六十条关于集体经营性建设用地入市的规定，而宅基地不属于经营性建设用地范畴。

建议处理方案：

1. 立即向乡镇人民政府土地管理部门举报该违法行为，要求撤销拍卖行为并恢复宅基地原状
   
2. 若已签订入股协议，可依据《民法典》第一百五十三条主张合同无效，要求返还宅基地使用权
   
3. 涉及集体资产处置的，可要求村委召开村民会议重新审议该事项，并公示处置方案及收益分配方案
   

如需进一步分析具体操作路径或文书准备，可提供拍卖合同、村民会议记录等材料后为您制定专项方案。