投资款逾期申报的处理需根据具体法律关系及合同约定分情况处理，核心结论如下：

1. 若涉及公司增资或股权投资

   • 法律性质：投资款逾期可能构成对《公司法》或投资协议的违约。根据《公司法》第28条，股东未按期足额缴纳出资的，除应向公司足额缴纳外，还需向其他已足额出资的股东承担违约责任。
     
   • 处理方式：
     
     • 催告程序：公司应首先向逾期股东发出书面催告，要求其在合理期限内（通常不超过30日）履行出资义务，并明确逾期后果（如利息、违约金或股权比例调整）。
       
     • 协议救济：若投资协议中约定了逾期出资的违约责任（如违约金、解除权或股权稀释条款），公司可依据协议主张权利。
       
     • 司法途径：若股东仍不履行，公司可向法院提起诉讼，要求其补缴出资并承担违约责任；若涉及虚假出资或抽逃出资，还可能触发刑事责任（《刑法》第159条）。
       

2. 若涉及民间借贷或项目投资

   • 法律性质：逾期申报可能涉及借款合同或投资合作协议的违约。根据《民法典》第675条，借款人未按约定期限返还借款的，应支付逾期利息；若为投资合作，则需按协议约定分配责任。
     
   • 处理方式：
     
     • 协商解决：双方可协商延长申报期限、调整投资条件或分期履行，并签订补充协议明确权利义务。
       
     • 合同救济：若协议中约定了逾期申报的解除权或赔偿条款，守约方可主张解除合同并要求赔偿损失（如预期收益、资金占用成本等）。
       
     • 诉讼或仲裁：若协商无果，可依据合同中的争议解决条款（如仲裁条款或管辖法院约定）提起诉讼或仲裁，要求对方履行义务或承担违约责任。
       

3. 若涉及破产程序中的债权申报

   • 法律性质：根据《企业破产法》第45条，债权人需在法院确定的债权申报期限内申报债权，逾期未申报的，不得依照破产程序行使权利。
     
   • 处理方式：
     
     • 补充申报：若逾期系因不可抗力或其他正当理由，可在破产财产最后分配前补充申报，但此前已进行的分配不再对其补充分配。
       
     • 普通债权处理：若未申报或补充申报未被认可，债权将转为普通债权，在破产财产分配顺序中处于较后位置，可能面临无法全额受偿的风险。
       

建议行动步骤：

1. 审查投资协议或合同，明确逾期申报的法律后果及救济条款；
   
2. 根据具体法律关系（公司法、合同法或破产法）选择合适的处理方式；
   
3. 保留书面催告、协商记录等证据，以备诉讼或仲裁使用；
   
4. 若涉及复杂交易结构或大额资金，建议委托律师介入，制定综合解决方案。
   

如有进一步细节（如合同条款、逾期原因等），可向我提供具体信息以便更精准分析。