占用、挖掘公路及公路用地的处罚主体主要是交通主管部门和公路管理机构。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律依据与处罚主体
《中华人民共和国公路法》的相关规定：
- 根据《中华人民共和国公路法》第七十六条，对于擅自占用、挖掘公路等违法行为，由交通主管部门责令停止违法行为，并可以处三万元以下的罚款。这一条款明确指出了交通主管部门在处理此类违法行为时的职责和权限。
《公路安全保护条例》的相关规定：
- 《公路安全保护条例》第五十六条和第六十一条也规定了对于在公路建筑控制区内违法建筑、在公路两侧种植植物影响通行等行为的处罚措施，这些处罚同样由公路管理机构负责执行。公路管理机构在公路保护方面扮演着重要角色，负责维护公路的畅通和安全。
二、不同违法行为的处罚主体与措施
擅自占用、挖掘公路：
- 处罚主体：交通主管部门。
- 处罚措施：责令停止违法行为，并可以处三万元以下的罚款。
在公路建筑控制区内违法建筑：
- 处罚主体：公路管理机构。
- 处罚措施：责令限期拆除，并可以处五万元以下的罚款。逾期不拆除的，由公路管理机构拆除，有关费用由违法行为人承担。
在公路两侧种植植物影响通行：
- 处罚主体：公路管理机构。
- 处罚措施：责令补种，没收违法所得，并处采伐林木价值三倍以上五倍以下的罚款。
三、处罚流程与注意事项
处罚流程：
- 立案：公路管理部门发现违法行为或接到举报后，决定是否立案调查。
- 调查取证：执法人员进行现场勘查，收集证据，确定违法事实、性质及情节。
- 告知：在作出行政处罚决定前，告知当事人违法事实、理由、依据及享有的权利。
- 听证（可选）：若当事人要求且符合条件，公路管理部门应组织听证。
- 作出处罚决定：根据调查结果和法律法规，制作并送达行政处罚决定书。
- 执行：当事人应按处罚决定履行义务。如不履行，公路管理部门可依法采取强制执行措施或申请人民法院强制执行。
注意事项：
- 处罚主体在执行处罚时，必须严格遵守法律法规的规定，确保处罚的合法性和公正性。
- 当事人对处罚决定有异议的，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
四、建议与总结
占用、挖掘公路及公路用地是严重的违法行为，不仅影响公路的畅通和安全，还可能引发交通事故和法律责任。因此，我建议公众严格遵守相关法律法规，不擅自占用或破坏公路用地。如果遇到相关问题或需要法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。维护公路的畅通和安全，是每个公民的责任和义务。