结论：在主张2倍工资的仲裁后协商同意调解的情况下，一般仍可以再申请要求补缴社保和公积金，但需注意调解协议内容、时效以及不同地区的具体规定等因素。以下为你详细分析：
- 从调解协议内容来看
- 如果在调解协议中，双方明确约定了该调解协议是对本次劳动争议所有事项的一次性了结，包括社保和公积金问题也一并处理完毕，那么在这种情况下，劳动者一般不能再就社保和公积金问题另行主张权利。因为调解协议是双方自愿达成的，具有法律效力，双方都应当遵守。
- 若调解协议中仅针对2倍工资问题进行了协商解决，没有涉及社保和公积金相关内容，那么劳动者有权就社保和公积金问题另行向相关部门主张权利。例如，劳动者可以向社会保险经办机构投诉，要求用人单位补缴社会保险；向住房公积金管理中心反映，要求用人单位补缴住房公积金。
- 从时效方面考虑
- 对于社保问题，根据《劳动保障监察条例》规定，违反劳动保障法律、法规或者规章的行为在2年内未被劳动保障行政部门发现，也未被举报、投诉的，劳动保障行政部门不再查处。不过，如果劳动者的权益一直处于受侵害状态，比如用人单位一直未为劳动者缴纳社保，那么时效可能会从侵害行为终止之日起计算。
- 对于公积金问题，各地规定可能有所不同，但一般来说，劳动者在知道或者应当知道自己的公积金权益受到侵害之日起一定期限内（如1 - 3年不等），可以向住房公积金管理中心投诉要求补缴。所以，即使经过了仲裁调解，只要在时效期内，劳动者仍可以主张补缴社保和公积金。
- 不同地区的具体规定差异
- 不同地区对于社保和公积金的补缴问题可能会有一些特殊的规定和操作流程。例如，某些地区可能要求劳动者先经过劳动仲裁前置程序，对社保和公积金问题进行仲裁后，才能向相关部门申请补缴；而有些地区则可能允许劳动者直接向社会保险经办机构或住房公积金管理中心投诉。因此，劳动者需要了解当地的具体规定，以便更好地维护自己的权益。
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