结论前置：员工不服从管理，用人单位一般不可以直接扣KPI工资，但可以根据合法有效的规章制度进行相应处理。
详细分析：
关于扣KPI工资的合法性：
- 直接扣减的非法性：根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，用人单位不得随意克扣。KPI工资作为工资的一部分，同样受到法律保护。因此，用人单位不能仅因员工不服从管理就直接扣减其KPI工资。
- 合法扣减的情形：如果员工的不服从管理行为违反了用人单位合法有效的规章制度，且该规章制度中明确规定了此类行为可以扣减工资或绩效，同时该规章制度已经过民主程序制定并公示，或者已经告知劳动者，那么用人单位可以依据规章制度进行相应处理。但即便如此，扣减的金额也应合理，且不能低于当地的最低工资标准。
用人单位应如何处理不服从管理的员工：
- 依据规章制度处理：用人单位应首先确保有合法有效的规章制度，并明确规定不服从管理的行为及其处理方式。在处理时，应确保程序合法，如通知员工、听取其陈述和申辩等。
- 培训或调岗：对于不服从管理的员工，用人单位可以考虑提供培训或调整其工作岗位，以帮助其改善行为。这既体现了用人单位的人文关怀，也有助于维护劳动关系的和谐稳定。
- 解除劳动合同：在员工的不服从管理行为严重违反规章制度或劳动合同约定，且经过培训或调岗后仍无改善的情况下，用人单位可以依据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定解除劳动合同。但在此过程中，用人单位应确保程序合法，如提前通知、支付经济补偿等。
员工的权益保护：
- 了解规章制度：员工应了解并遵守用人单位的规章制度，以避免因不了解规定而遭受不必要的损失。
- 维护合法权益：如果员工认为用人单位的处理方式不合法或不合理，可以通过与用人单位协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式维护自己的合法权益。
建议与提醒：
- 用人单位：应建立健全的规章制度，并确保其合法有效。在处理不服从管理的员工时，应遵循合法、公正、合理的原则，避免侵犯员工的合法权益。
- 员工：应了解并遵守用人单位的规章制度，积极履行自己的工作职责。如果遇到不公正的处理方式，应及时寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
后续行动指导：
如果您作为用人单位或员工，在处理此类问题时遇到困惑或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供详细的法律建议和解决方案。