结论：企业自己投的变电站，用户因欠工程款，企业一般不能直接切断用户用电。以下从不同角度为你详细分析：
法律层面
- 供电合同关系角度
- 企业投资建设变电站并为用户供电，通常与用户之间形成了供电合同关系。根据《中华人民共和国民法典》中关于合同的规定，合同双方应当按照约定全面履行自己的义务。在供电合同中，供电方（企业）有义务按照约定向用电方（用户）持续、稳定地供电，用电方则有义务按照约定支付电费等费用。
- 如果用户欠付的是工程款，而非电费，企业直接切断用户用电，这属于违反供电合同中持续供电义务的行为，可能构成违约。用户有权依据合同约定和法律规定，要求企业继续履行供电义务，并可能要求企业承担因停电造成的损失赔偿责任。
- 物权与相邻关系角度
- 企业投资建设的变电站，其物权归企业所有。但变电站的供电行为涉及到公共利益和相邻关系。根据《中华人民共和国民法典》中关于相邻关系的规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。
- 企业切断用户用电，可能会影响到用户的正常生产生活，甚至可能对公共安全造成影响。如果因此引发纠纷，企业可能需要承担相应的法律责任。
- 特殊情况下的合法断电
- 虽然一般情况下企业不能因欠工程款切断用户用电，但在某些特殊情况下，企业可能可以合法断电。例如，如果企业与用户在合同中明确约定，当用户欠付工程款达到一定金额或期限时，企业有权切断供电，并且该约定不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么在这种情况下，企业切断用户用电可能具有一定的合法性。
- 另外，如果用户存在严重危害供电安全、窃电等违法行为，企业根据相关法律法规和供电合同的规定，也有权采取停电等措施。但这种情况与欠工程款是不同的法律关系和事实情形。
实际处理建议
- 协商解决
- 企业可以首先与用户进行友好协商，向用户说明欠付工程款的情况，要求用户尽快支付欠款。在协商过程中，可以探讨制定合理的还款计划，以避免因欠款问题引发更严重的纠纷。
- 发送催款通知
- 如果协商无果，企业可以向用户发送正式的催款通知，明确告知用户欠款的金额、期限以及可能面临的法律后果，要求用户在一定期限内支付欠款。催款通知可以作为企业后续采取法律措施的证据之一。
- 提起诉讼或申请仲裁
- 如果用户仍然拒绝支付欠款，企业可以根据与用户签订的合同中的争议解决条款，选择向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，通过法律途径维护自己的合法权益。在诉讼或仲裁过程中，企业需要提供充分的证据证明用户欠付工程款的事实以及自己的损失情况。
企业在处理与用户因欠工程款而可能引发的断电问题时，应当谨慎行事，遵循法律法规的规定，通过合法、合理的途径解决问题。如果你还有其他关于合同纠纷方面的问题，欢迎直接向我咨询。