公司成立时合作方以专利作价入股，对股东双方是否公平，这并非一个绝对的问题，而是取决于多种因素的综合考量。以下从不同角度为你详细分析：
一、公平性的积极体现
资源互补与价值最大化：
- 如果合作方拥有的专利技术是公司业务发展所必需的，且该专利具有较高的市场价值和应用前景，那么以专利作价入股可以实现资源的有效整合和互补。这样，公司能够迅速获得关键技术，提升市场竞争力，而合作方也能通过股权形式分享公司未来的成长收益，实现双方共赢。
激励创新与合作：
- 专利作价入股可以激励合作方持续投入研发，保持技术领先，因为其利益与公司的发展紧密相连。同时，这种合作方式也有助于促进双方之间的深度合作，共同推动技术创新和业务发展。
二、可能存在的不公平因素
专利价值评估的准确性：
- 专利的价值往往难以准确评估，受到市场前景、技术成熟度、法律保护状况等多种因素的影响。如果评估价值过高，可能导致合作方以较低的成本获得较高的股权比例，从而损害其他股东的利益；反之，如果评估价值过低，则可能让合作方感到不公平。
- 建议：在评估专利价值时，应委托专业的评估机构进行，并充分考虑各种因素，确保评估结果的公正性和准确性。
股权比例与贡献的匹配性：
- 除了专利价值外，合作方在公司成立过程中的其他贡献（如资金、市场渠道、管理经验等）也应纳入考虑范围。如果仅以专利作价入股而忽视其他贡献，可能导致股权比例与实际贡献不匹配，从而引发不公平感。
- 建议：在确定股权比例时，应综合考虑合作方的各项贡献，确保股权分配的合理性和公平性。
未来收益与风险的分担：
- 专利作价入股后，合作方将与公司共同承担未来的经营风险和收益。如果公司经营不善或专利技术被淘汰，合作方可能面临股权价值缩水的风险。因此，在决定是否以专利作价入股时，合作方应充分评估公司的经营前景和专利技术的市场潜力。
- 建议：在合作协议中明确约定风险分担机制和收益分配方式，以保障双方的合法权益。
三、法律保障与协议约定
法律保障：
- 根据《公司法》等相关法律法规的规定，股东可以用货币出资，也可以用实物、知识产权、土地使用权等可以用货币估价并可以依法转让的非货币财产作价出资。因此，专利作价入股在法律上是可行的。
协议约定：
- 为了确保公平性和避免潜在纠纷，双方应在合作协议中明确约定专利作价入股的具体条款，包括专利的评估方法、股权比例、收益分配、风险分担等。通过详细的协议约定，可以保障双方的权益并促进合作的顺利进行。
总结来看，公司成立时合作方以专利作价入股对股东双方是否公平，取决于专利价值的评估准确性、股权比例与贡献的匹配性、未来收益与风险的分担以及法律保障与协议约定等多种因素。因此，在决定是否以专利作价入股时，双方应充分协商并谨慎考虑各种因素，以确保合作的公平性和可持续性。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。