结论：公司漏打卡按事假算是否合法，需根据具体情况判断，若公司规章制度合法且已告知员工，同时员工漏打卡行为符合事假情形，则合法；反之则不合法。以下从不同角度详细分析：
一、公司规章制度合法性角度
规章制度制定程序合法：
- 根据《劳动合同法》第四条，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 若公司漏打卡按事假算的规章制度未经上述程序制定，则该制度可能因程序违法而无效。
规章制度内容合法：
- 规章制度内容不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得违背公序良俗。
- 若公司规章制度中规定漏打卡一律按事假算，且未考虑员工漏打卡的合理原因（如设备故障、忘记打卡等），则该规定可能因内容不合理而无效。
规章制度已告知员工：
- 用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
- 若公司未将漏打卡按事假算的规章制度告知员工，则员工有权主张该制度对其不产生约束力。
二、员工漏打卡行为角度
员工漏打卡的合理原因：
- 若员工因设备故障、忘记打卡等合理原因漏打卡，且能提供相应证据（如设备故障记录、同事证言等），则公司不应直接按事假算。
- 在此情况下，公司应要求员工补签考勤表或提供其他证明出勤的证据，以确认员工的实际出勤情况。
员工漏打卡的无合理原因：
- 若员工因故意或重大过失漏打卡，且无法提供合理原因，则公司可以根据规章制度按事假算。
- 但在此情况下，公司也应确保规章制度的合法性和合理性，并遵循公平、公正、公开的原则进行处理。
三、法律后果与建议
法律后果：
- 若公司规章制度合法且已告知员工，同时员工漏打卡行为符合事假情形，则公司按事假算扣减工资等行为合法。
- 若公司规章制度违法或未告知员工，或者员工漏打卡行为有合理原因，则公司按事假算扣减工资等行为可能违法，员工有权要求公司补发工资或承担其他法律责任。
建议：
- 对于公司而言，应制定合法、合理的规章制度，并确保已告知员工。在处理员工漏打卡问题时，应遵循公平、公正、公开的原则，考虑员工的合理原因和实际情况。
- 对于员工而言，应遵守公司的规章制度，按时打卡出勤。若因合理原因漏打卡，应及时向公司说明情况并提供相应证据，以维护自己的合法权益。
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