核心结论：房屋借用协议时限不明确时，双方可通过协商补充明确时限；若协商不成，可依据法律规定或交易习惯处理，必要时可通过法律途径解决争议。以下是具体分析：

1. 协商补充明确时限
   根据《民法典》第五百一十条，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充。因此，双方可重新协商并签订补充协议，明确借用期限。这是最直接、高效的方式，既能维护双方关系，又能避免后续纠纷。

2. 依据法律规定或交易习惯处理
   若协商未果，可参考以下规则：

   • 合理期限推定：根据《民法典》第五百一十一条，履行期限不明确的，债务人可以随时履行，债权人也可以随时请求履行，但应当给对方必要的准备时间。在房屋借用中，可结合借用目的、房屋用途（如居住、仓储等）及行业惯例，推定一个“合理期限”。例如，居住用途可能默认为1-2年，商业用途可能更短。
     
   • 交易习惯参考：若双方此前有类似交易或当地存在普遍做法（如“口头约定借用至某事件发生”），可作为补充依据。但需注意，交易习惯需经双方认可或法院认定，不可单方主张。

3. 法律途径解决争议
   若双方对时限分歧较大，且无法通过协商或习惯解决，可采取以下措施：

   • 起诉要求返还房屋：出借方可主张借用关系因时限不明属于“不定期借用”，依据《民法典》第七百三十条，随时可以解除合同，但需在合理期限前通知对方。
     
   • 反诉要求继续履行：借用方若认为出借方恶意解除合同，可反诉要求继续履行，并主张出借方承担违约责任（如赔偿搬迁损失）。
     
   • 证据固定是关键：无论选择哪种途径，均需提供证据证明借用事实（如协议文本、聊天记录、证人证言等）及实际使用情况（如水电费缴纳记录、房屋维护记录等）。

温馨提示：房屋借用协议虽不要求书面形式，但为避免争议，建议签订书面协议并明确时限、用途、费用等条款。若已签订协议但时限不明，可尽快通过补充协议或律师函固定双方权利义务。如有具体案件细节，可进一步向我咨询，我会结合证据为您分析风险点及应对策略。