结论：系统显示逾期后换卡号，是否还会自动扣款，这主要取决于贷款合同中的约定以及银行或贷款机构的具体操作流程。以下从不同角度进行分析：
合同约定角度：
- 自动扣款条款：首先，需要查看贷款合同中是否有关于自动扣款的明确条款。如果合同中规定了即使更换卡号，银行或贷款机构仍有权通过其他方式（如关联账户、手动操作等）进行扣款，那么即使换了卡号，也可能面临被扣款的风险。
- 通知义务：合同中可能还规定了借款人在更换卡号时的通知义务。如果借款人未按照合同要求及时通知银行或贷款机构，那么银行或贷款机构可能仍会按照原卡号进行扣款尝试，尽管这在实际操作中可能因卡号无效而失败，但借款人仍需承担因未履行通知义务而可能产生的法律责任。
银行或贷款机构操作流程角度：
- 系统更新：如果借款人及时通知了银行或贷款机构更换了卡号，并且银行或贷款机构的系统能够及时更新这一信息，那么理论上来说，银行或贷款机构应该按照新的卡号进行扣款。
- 手动操作：然而，在实际操作中，如果银行或贷款机构的系统未能及时更新或存在其他技术问题，或者扣款操作需要人工干预（如某些特殊情况下的手动扣款），那么即使换了卡号，也可能因为系统或人为因素而导致扣款失败或错误扣款。
法律后果与建议：
- 法律后果：如果因为更换卡号而未能按时还款，借款人可能面临逾期还款的法律后果，包括但不限于罚息、信用记录受损、被催收甚至被起诉等。
- 建议：
- 及时沟通：在更换卡号后，借款人应立即与银行或贷款机构沟通，确保他们了解并更新了借款人的还款账户信息。
- 保留证据：借款人应保留好更换卡号的通知记录以及银行或贷款机构的确认回复，以备不时之需。
- 关注还款：无论是否更换卡号，借款人都应密切关注还款情况，确保按时足额还款，以避免不必要的法律纠纷和信用损失。
进一步思考：在实际操作中，为了避免因更换卡号而导致的还款问题，借款人可以在更换卡号前与银行或贷款机构协商，了解他们的具体操作流程和要求，并按照要求进行操作。同时，借款人也可以考虑设置自动还款功能（如果银行或贷款机构提供），以确保还款的及时性和准确性。如果有任何疑问或遇到问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。