股东因出资问题承担补充赔偿责任，原则上不会牵连其配偶的财产，但在特定情况下可能会涉及。以下从不同角度进行分析：

一、一般原则：不牵连配偶财产

1. 法律责任独立性：股东因出资问题承担的补充赔偿责任，是基于其作为公司股东的身份和出资义务而产生的法律责任。这种责任具有独立性，原则上应由股东个人承担，不会直接牵连到其配偶的财产。
2. 夫妻共同财产的界定：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产，为夫妻的共同财产，归夫妻共同所有。然而，股东因出资问题产生的债务，并不属于夫妻共同债务的范畴，除非该债务被认定为用于夫妻共同生活、共同生产经营或者基于夫妻双方共同意思表示。

二、特定情况：可能涉及配偶财产

1. 债务用于夫妻共同生活或生产经营：如果股东因出资问题产生的债务，被证实用于夫妻共同生活或共同生产经营，那么该债务可能被认定为夫妻共同债务。在这种情况下，配偶的财产可能会被用于偿还该债务。但需要注意的是，这种认定需要严格的证据支持，不能仅凭主观臆断。
2. 配偶参与公司经营或知情并同意：如果配偶实际参与了公司的经营，或者对股东的出资问题知情并同意，那么在某些情况下，配偶也可能被视为共同债务人，需要承担相应的法律责任。但这同样需要具体的证据来支持。
3. 财产混同：如果股东与其配偶的财产存在混同情况，即无法清晰区分个人财产和夫妻共同财产，那么在股东因出资问题承担补充赔偿责任时，可能会涉及配偶的财产。但这种情况较为复杂，需要具体分析财产混同的程度和原因。

三、法律建议

1. 明确债务性质：对于股东因出资问题产生的债务，应首先明确其性质是否属于夫妻共同债务。如果不是，则原则上不会牵连配偶的财产。
2. 保留证据：如果担心债务可能涉及配偶的财产，建议保留相关证据，如债务用途的证明、配偶是否参与公司经营的证据等，以备不时之需。
3. 咨询专业律师：在涉及复杂法律问题时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和解决方案。

总结来说，股东因出资问题承担补充赔偿责任，在一般情况下不会牵连其配偶的财产。但在特定情况下，如债务用于夫妻共同生活或生产经营、配偶参与公司经营或知情并同意、财产混同等，可能会涉及配偶的财产。因此，在处理此类问题时，应谨慎分析具体情况，并咨询专业律师以获取更准确的法律意见。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。