在暂扣特种行业许可证（特行证）期间继续营业的，将面临行政处罚，具体处罚措施需根据违法情节的严重程度确定，可能包括罚款、没收违法所得、责令停业整顿，甚至吊销许可证。以下是详细分析：

1. 法律依据与处罚原则
   根据《行政许可法》第八十条及《治安管理处罚法》第五十四条，被许可人（如旅馆、印章刻制等特种行业经营者）在许可证被暂扣期间擅自从事相关经营活动的，属于“未取得许可擅自经营”的违法行为。行政机关将依据违法情节的严重程度（如营业时间、规模、是否造成危害后果等）作出处罚。

2. 具体处罚措施

   • 罚款：根据《治安管理处罚法》第五十四条，可处五日以上十日以下拘留，并处五百元以上一千元以下罚款；情节较轻的（如初次违法、营业时间短、未造成危害后果），可处五日以下拘留或五百元以下罚款。
     
   • 没收违法所得：若继续营业期间有收入，行政机关可依法没收全部违法所得。
     
   • 责令停业整顿：若违法情节较重（如多次违法、营业规模较大、存在安全隐患），可能被责令停业整顿，期限由行政机关根据情况确定。
     
   • 吊销许可证：若违法情节严重（如造成重大安全事故、社会影响恶劣），原发证机关可能直接吊销特种行业许可证，且经营者可能面临五年内不得再次申请该许可的限制。

3. 情节认定与加重处罚情形

   • 从重处罚情形：若继续营业期间发生安全事故、存在安全隐患未整改、拒不配合执法检查等，可能被认定为“情节严重”，从而面临更严厉的处罚（如吊销许可证）。
     
   • 从轻或减轻处罚情形：若经营者主动停止违法行为、配合调查、未造成危害后果，可能被从轻或减轻处罚（如仅罚款不拘留）。

4. 实务建议

   • 立即停止营业：在特行证被暂扣期间，应第一时间停止相关经营活动，避免违法状态持续。
     
   • 配合调查与整改：主动联系发证机关或执法部门，说明情况并配合调查，及时整改存在的问题（如消除安全隐患）。
     
   • 申请复议或诉讼：若认为暂扣许可证的行政行为违法或处罚过重，可在法定期限内申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。

温馨提示：特种行业经营涉及公共安全和社会秩序，行政机关对违法行为的处罚力度较大。若您或您的企业面临此类问题，建议直接向我咨询具体应对方案，我会结合案件细节为您提供专业法律意见。