针对您提出的“九米六货车超长40公分怎么处罚”的问题，以下是我根据相关法律法规及实际执法情况为您提供的详细解答：

首先，需要明确的是，货车超长（或超宽、超高）是违反《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例的行为。对于您提到的九米六货车超长40公分的情况，这通常会被视为一种违法行为，并会受到相应的处罚。

处罚依据：

1. 《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条：该条款规定，机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规关于道路通行规定的，处警告或者二十元以上二百元以下罚款。这是货车超长行为的基本处罚框架。

2. 《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第五十四条：该条款明确规定，机动车载物不得超过机动车行驶证上核定的载质量，装载长度、宽度不得超出车厢。货车超长40公分显然违反了这一规定。

3. 《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十二条：该条款规定，驾驶机动车载货长度、宽度、高度超过规定的，一次记1分。这意味着超长行为不仅涉及罚款，还会对驾驶员的驾驶证记分产生影响。

具体处罚：

• 罚款：根据上述法规，货车超长40公分通常会被处以20元以上200元以下的罚款。具体罚款数额会结合当地的具体规定以及超长行为的严重程度来确定。例如，某些地区可能直接按最低标准处20元罚款，而另一些地区则可能处以接近200元的罚款。

• 记分：同时，驾驶员的驾驶证会被记1分。这是为了提醒驾驶员注意遵守交通法规，确保行车安全。

特殊情形：

• 如果货车超长行为特别严重，如导致交通事故或严重阻碍交通，那么驾驶员可能会面临更严厉的处罚，包括但不限于更高的罚款、扣分甚至吊销驾驶证等。

建议：

• 由于具体罚款数额和处罚措施可能因地区和具体情况而有所不同，我建议您在面临此类问题时，及时咨询当地的交通管理部门或专业律师，以获取最准确的信息和法律建议。

综上所述，九米六货车超长40公分是一种违法行为，将面临法律的制裁。作为驾驶员，您应严格遵守道路交通安全法律法规，确保车辆装载符合规定，以避免不必要的法律风险和损失。