结论：建设单位在未竣工的车间内增加设备用房是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断，主要看是否违反了相关法律法规、施工许可范围以及合同约定。以下从不同角度进行分析：

一、法律法规角度

1. 施工许可范围：

   • 根据《中华人民共和国建筑法》及相关规定，建设单位在取得施工许可证后，应按照施工许可证确定的范围进行施工。若原施工许可证中并未包含新增的设备用房，则建设单位擅自增加可能构成违法施工，需要重新申请施工许可或办理相关变更手续。

2. 规划许可：

   • 新增设备用房若涉及建筑结构的改变或建筑面积的增加，可能还需要符合城市规划的要求，并取得相应的规划许可。未经规划部门批准擅自建设，同样可能构成违法。

二、合同约定角度

1. 施工合同：

   • 若建设单位与施工单位签订的施工合同中明确约定了施工范围，且未包含新增的设备用房，则建设单位擅自要求增加可能构成违约。施工单位有权拒绝，并可能要求建设单位承担违约责任。

2. 设计变更：

   • 若因设计变更等原因需要增加设备用房，建设单位应与施工单位、设计单位等协商一致，并签订设计变更协议。未经协商一致擅自变更设计，同样可能引发法律纠纷。

三、实际操作建议

1. 核查施工许可和规划许可：

   • 建设单位应首先核查原施工许可证和规划许可的范围，确定新增设备用房是否需要重新申请许可或办理变更手续。

2. 与施工单位协商：

   • 若需增加设备用房，建设单位应与施工单位进行充分沟通，明确施工范围、工期、费用等事项，并签订补充协议或设计变更协议。

3. 遵守法律法规和合同约定：

   • 在整个施工过程中，建设单位应严格遵守相关法律法规和合同约定，确保施工活动的合法性和合规性。

后续行动建议：若您作为建设单位面临此类情况，建议先核查相关许可和合同约定，再与施工单位协商解决方案。如有需要，可进一步向我咨询具体的法律程序和操作步骤，以确保您的权益得到保障。