企业罚款的管理部门需根据罚款性质及实施主体进行区分，具体如下：

1. 行政罚款
   若企业因违反行政法规（如环保、税务、安全生产等）被政府部门处罚，管理主体为作出处罚决定的行政机关。例如：

   • 环保罚款由生态环境部门管辖；
     
   • 税务罚款由税务机关管辖；
     
   • 安全生产罚款由应急管理部门管辖。
     法律依据：根据《行政处罚法》第十七条，行政处罚由具有行政处罚权的行政机关在法定职权范围内实施。

2. 企业内部罚款
   若企业依据规章制度对员工进行罚款（如迟到、旷工等），需满足以下条件：

   • 合法性前提：规章制度需经民主程序制定（如职工代表大会讨论）并公示；
     
   • 合理性限制：罚款金额不得超过当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地最低工资标准；
     
   • 管理主体：由企业人力资源部门或工会监督执行，但员工有权通过劳动仲裁主张权益。
     法律依据：根据《劳动合同法》第四条及《工资支付暂行规定》第十六条，企业罚款需以合法制度为前提，且不得滥用。

3. 司法罚款
   若企业因妨碍诉讼（如伪造证据、拒不履行生效判决）被法院处罚，管理主体为人民法院。例如：

   • 对单位罚款金额为人民币五万元以上一百万元以下；
     
   • 罚款决定需经法院院长批准，并出具书面裁定书。
     法律依据：根据《民事诉讼法》第一百一十八条及《行政诉讼法》第九十六条，司法罚款由法院直接执行。

建议：若企业面临罚款争议，需首先明确罚款性质及实施主体，再通过行政复议、劳动仲裁或诉讼等途径维权。如有具体案件细节，可直接向我咨询进一步分析。