若因仅有转账记录，法院认定双方为合作关系导致败诉，你可以从以下方面处理：

1. 分析败诉原因，针对性收集新证据
   • 明确合作关系认定依据：仔细研究法院判决书，弄清楚法院是基于哪些事实和证据认定双方为合作关系的。比如，是否存在一些聊天记录、邮件往来、会议纪要等，其中提及了合作事项、利润分配、风险共担等内容；或者双方在实际行为中是否有共同经营、共同管理、共享收益、共担风险等合作特征。
   • 收集反驳证据：根据法院认定的合作依据，有针对性地收集能够证明双方并非合作关系的证据。如果是借款关系，可以寻找能证明对方有还款意思表示的证据，如对方承诺还款的书面材料、录音等；若能证明转账时明确约定了还款期限、利息等借款要素，也能有力反驳合作关系的认定。另外，还可以收集证人证言，比如了解双方关系和转账情况的第三方，证明转账的性质是借款而非合作投资。
2. 考虑是否上诉
   • 上诉期限：在收到判决书之日起15日内向上一级人民法院提起上诉。如果超过这个期限，判决书就会生效，你将失去通过上诉改变判决结果的机会。
   • 上诉理由和证据：整理好能够证明一审判决认定事实错误或适用法律错误的理由和证据。比如，新收集到的能够证明借款关系的证据，或者指出一审法院在认定合作关系时存在逻辑错误、对证据的解读不准确等问题。在上诉状中清晰、准确地阐述你的上诉请求和理由，以提高上诉成功的几率。
3. 若错过上诉期或上诉失败，可考虑其他途径解决
   • 申请再审：如果发现新的证据，足以推翻原判决、裁定；或者原判决、裁定认定事实的主要证据是伪造的；或者原判决、裁定适用法律确有错误等法定情形，可以在判决、裁定生效后6个月内向上一级人民法院申请再审。申请再审需要提交再审申请书和相关证据材料，详细说明再审的理由和依据。
   • 协商解决：尽管法院判决双方为合作关系，但你可以尝试与对方进行协商，看是否能够就转账的性质和后续处理达成一致意见。比如，双方可以签订一份协议，明确转账是借款，并约定还款计划和方式等。这种方式可以避免进一步的法律纠纷，节省时间和精力。
   • 另案起诉：如果能够收集到充分的证据证明存在其他法律关系，比如不当得利等，可以以新的法律关系为由向法院另行起诉。例如，如果转账是因为对方错误收款，你可以以不当得利为由要求对方返还转账款项。在起诉时，需要提供能够证明不当得利事实的证据，如转账记录、对方没有合法依据取得款项的证明等。