不动产二拍流拍后，债务人不同意以物抵债的，法院不能强制执行以物抵债。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与权利保障
《最高人民法院关于人民法院民事执行中拍卖、变卖财产的规定》：
- 根据该规定，对于第二次拍卖仍流拍的不动产或其他财产权，法院可以采取多种处理方式，包括以物抵债。但这一方式并非强制性的，而是需要征得债务人的同意或满足特定条件。
债务人的选择权：
- 债务人有权拒绝以物抵债的提议。如果债务人不同意，法院不能强制将房屋抵债给债权人。这是基于民事法律关系的自愿原则，即当事人有权自主决定其民事权利义务的设定、变更和消灭。
二、以物抵债的条件与程序
前提条件：
- 以物抵债通常是在拍卖流拍后，且债权人同意接受该财产作为履行债务的方式时进行的。如果债权人不接受以物抵债，或者双方无法就抵债的具体条款达成一致，那么以物抵债就无法进行。
程序要求：
- 在实际操作中，以物抵债需要经过严格的法律程序，包括评估、公告、协商等环节。这些程序旨在确保以物抵债的公平性和合法性，保护双方的合法权益。
三、债务人的其他选择及法院的处理方式
再次拍卖或变卖：
- 如果债务人不同意以物抵债，法院可以继续尝试通过其他方式处置该财产，如降低价格后再次拍卖或变卖。这是为了保障债权人的合法权益，同时尊重债务人的意愿。
法院的处理方式：
- 若申请执行人（债权人）明确表示拒绝接受以物抵债，法院应当裁定解除对该房产的查封、扣押等执行措施，并将该财产退还被执行人（债务人）。同时，申请执行人可能因此丧失通过本次执行程序实现债权的机会，但并不意味着其债权就此消灭。申请执行人仍可在发现被执行人有其他可供执行的财产时，向法院申请恢复执行。
四、特殊情况下的处理
- 在某些涉及多个债权人的案件中，若需通过以物抵债方式分配财产，可能需要召开债权人会议进行表决。此时，即使个别申请执行人拒绝以物抵债，也不影响其他债权人通过表决程序接受以物抵债。但需注意，此情况并非普遍适用于所有强制执行案件。
总结与建议：
不动产二拍流拍后，如果债务人不同意以物抵债，法院不能强制执行。此时，法院可能会考虑再次拍卖或变卖该财产，或者根据申请执行人的意愿和法律规定采取其他执行措施。作为债务人或债权人，在面对这种情况时，应充分了解相关法律规定和程序要求，积极与法院沟通协商，以寻求最佳解决方案。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。