在电瓶车与机动车发生碰撞且双方被判定为同等责任的情况下，赔偿处理需遵循一系列明确的步骤和法律规定。以下是我作为杨茂峥律师，结合专业知识和实践经验，给出的详细解答：
赔偿原则与交强险优先赔付
赔偿原则：在同等责任下，赔偿将首先通过交强险进行，超出交强险限额的部分则根据双方的责任比例分担。实践中，考虑到电瓶车作为相对弱势一方，机动车方通常承担60%-70%的赔偿责任，电瓶车方承担30%-40%，具体比例可根据实际情况调整。
交强险赔付：
- 机动车交强险在责任限额内赔偿，不区分责任比例。具体限额为：死亡伤残赔偿限额18万元，医疗费用赔偿限额1.8万元，财产损失赔偿限额2000元。
- 若电瓶车方有损失，且损失在交强险赔偿限额内，则由机动车方的交强险全额赔付。
- 若机动车方也有损失，且电瓶车方投保了交强险（如有），则由电瓶车方的交强险在限额内赔付；若电瓶车未投保交强险，则由电瓶车方按责任比例承担。
超出交强险部分的责任分担与商业险作用
超出交强险部分的责任分担：
- 对于超出交强险赔偿限额的部分，双方根据责任比例分担。如前所述，机动车方通常承担更高比例。
- 例如，若电瓶车维修费为3000元，交强险赔付2000元后，剩余1000元按60%:40%比例分担，机动车方再赔600元，电瓶车方自负400元。
商业险的作用：
- 机动车若购买商业第三者责任险，超出交强险部分的赔偿责任可由商业险承担。
- 例如，上述机动车需赔偿的600元，若符合商业险理赔条件，可由商业险赔付。
赔偿流程与注意事项
赔偿流程：
- 及时报警与通知保险公司：事故发生后立即报警并通知保险公司，以便勘查现场、出具责任认定书及查勘定损。
- 协商赔偿：双方根据责任认定和保险理赔情况协商赔偿事宜，力求达成一致。
- 准备理赔材料：收集事故责任认定书、医疗费用发票、病历、车辆维修发票等理赔所需材料。
- 申请理赔：向保险公司提交理赔申请，按照要求提供相关资料。
- 诉讼解决：若协商不成，可向人民法院提起诉讼，通过法律途径解决争议。
注意事项：
- 保留证据：在整个赔偿过程中，务必保留好所有相关证据和文件，如事故现场照片、医疗记录、维修发票等。
- 及时沟通：与保险公司保持密切沟通，了解理赔进度和所需材料。
- 了解保险条款：熟悉保险合同中的条款和条件，特别是免赔率、赔付限额等限制，以便在理赔时做到心中有数。
特殊情况说明
- 虽然理论上双方各承担50%的责任，但在实际操作中，出于保护弱者原则，机动车方往往承担更高比例的责任。
- 若电瓶车方存在严重违规行为（如闯红灯、逆行等），可能影响责任比例的划分，此时需根据具体情况进行判断。
总结与建议
在处理电瓶车与机动车碰撞事故时，应充分了解赔偿项目、交强险及商业险的赔付规则，并按照法定流程进行操作。同时，保留好所有相关证据，以便在需要时维护自己的合法权益。若遇复杂情况或争议，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律帮助。