核心结论：车辆转让协议不规范，可通过协商补充完善、依据法律认定效力、通过诉讼或仲裁解决争议等方式处理，具体如下：
- 协商补充完善协议
- 沟通协商：当发现车辆转让协议不规范时，首先建议双方进行友好协商。因为很多不规范的情况可能只是条款表述不清晰、遗漏某些重要事项等，通过沟通可以明确双方的真实意图。例如，协议中没有明确约定车辆过户的时间，双方可以就此进行协商，确定一个合理的过户期限。
- 签订补充协议：在协商达成一致后，签订书面的补充协议。补充协议要对原协议中不规范的部分进行修正和完善，确保协议内容完整、明确、合法。比如，原协议对车辆的瑕疵情况没有详细说明，补充协议可以详细列出车辆存在的瑕疵以及双方对于瑕疵的责任承担方式。
- 依据法律规定认定协议效力
- 部分无效与整体无效的区分：根据《民法典》的相关规定，如果协议中存在违反法律、行政法规的强制性规定或者违背公序良俗的条款，这些条款是无效的，但并不影响协议中其他有效条款的效力。例如，协议中约定逃避车辆交易税费，此条款无效，但协议中关于车辆转让价格、交付方式等其他条款仍然有效。如果协议的不规范情况严重到导致整个协议的目的无法实现，或者违反了法律的强制性规定且无法通过补充协议等方式进行修正，那么整个协议可能被认定为无效。
- 可撤销协议的情形：如果一方以欺诈、胁迫的手段或者乘人之危，使对方在违背真实意思的情况下签订了车辆转让协议，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议。比如，卖方故意隐瞒车辆发生过重大事故的事实，导致买方在不知情的情况下签订了协议，买方可以申请撤销该协议。
- 通过诉讼或仲裁解决争议
- 诉讼途径：如果双方无法通过协商解决协议不规范带来的问题，一方可以向人民法院提起诉讼。在诉讼过程中，法院会根据双方提供的证据，依据相关法律规定，对协议的效力、双方的权利义务等进行判决。例如，买方认为卖方交付的车辆与协议约定不符，要求卖方承担违约责任，法院会根据协议的具体内容以及实际情况进行裁决。
- 仲裁途径：如果双方在协议中约定了仲裁条款，或者事后达成了仲裁协议，那么一方可以向约定的仲裁机构申请仲裁。仲裁具有一裁终局的特点，相对诉讼来说，程序更加简便、快捷。比如，双方在协议中约定因协议产生的争议由某仲裁委员会仲裁，当出现争议时，就可以向该仲裁委员会申请仲裁。