在保险赔偿调解协议中，保险公司和撞人司机同意将赔偿款转给受伤人，这一安排通常基于以下法律逻辑和实务考量，分情况说明如下：

1. 明确赔偿对象与责任归属
   根据《民法典》第1179条，侵权人（撞人司机）需对受害人的医疗费、护理费、误工费等损失承担赔偿责任。保险公司作为机动车第三者责任险的承保方，其赔偿义务本质是代司机履行赔偿责任。协议中明确款项直接支付给受伤人，可避免司机与保险公司之间因赔偿款流转产生争议，确保受害人的损失得到直接填补。

2. 简化赔偿流程与效率优先
   实务中，若赔偿款先支付给司机再转交受害人，可能因司机拖延、挪用或失联导致受害人无法及时获赔。协议直接约定支付给受害人，可缩短赔偿周期，减少中间环节风险。例如，在交强险“垫付与追偿”规则中，保险公司亦可直接向受害人支付抢救费用，此逻辑与调解协议中的直接支付安排一致。

3. 防范道德风险与法律纠纷
   若协议未明确支付对象，司机可能以“已将款项交保险公司”为由拒绝再次赔偿，而保险公司可能以“未收到司机授权”为由拒绝支付，导致受害人陷入“两头落空”的困境。直接约定支付给受害人，可固定各方权利义务，降低后续诉讼风险。

4. 调解协议的合同效力约束
   根据《人民调解法》第31条，经调解达成的协议具有法律约束力，当事人应履行。协议中明确支付对象后，若保险公司或司机未按约定支付，受害人可直接依据协议向法院申请支付令或提起违约之诉，无需再就“赔偿款归属”另行举证。

实务建议：

• 受害人签署协议前，应核对赔偿项目是否覆盖全部损失（如医疗费、残疾赔偿金等），避免遗漏；
  
• 若涉及分期支付，需在协议中明确每期金额、支付时间及违约责任；
  
• 协议签署后，建议要求保险公司或司机提供付款凭证（如银行转账记录），确保款项实际到账。
  

如有具体协议条款需要审查或赔偿金额计算疑问，可直接向我咨询。