结论：银行卡免密支付关闭后，若存在逾期情况，是否还会扣钱取决于多个因素，包括逾期费用的性质、银行卡的扣款权限以及银行的具体操作等。以下是对这一问题的详细分析：
逾期费用的性质：
- 如果逾期费用是与银行卡直接相关的费用，如年费、滞纳金等，且这些费用在银行卡免密支付功能关闭前已经产生，那么银行通常有权在银行卡有余额的情况下进行扣款，无论免密支付功能是否开启。这是因为这些费用是银行卡使用过程中产生的，与免密支付功能无直接关联。
- 如果逾期费用是与银行卡绑定的其他服务（如贷款、信用卡还款等）产生的，且这些服务在免密支付功能关闭后仍然有效，那么银行或相关服务机构也可能在银行卡有余额的情况下进行扣款。这取决于服务协议中的具体条款和银行的操作规定。
银行卡的扣款权限：
- 银行卡的扣款权限通常由银行根据相关法律法规和内部规定进行设定。即使免密支付功能关闭，银行仍可能根据其他授权或协议进行扣款。例如，如果用户与银行签订了自动还款协议，银行有权在还款日从银行卡中扣除相应款项。
银行的具体操作：
- 不同银行对于逾期费用的处理方式可能存在差异。有些银行可能会在免密支付功能关闭后停止所有自动扣款，包括逾期费用的扣款；而有些银行则可能继续扣款，直到逾期费用得到清偿或用户主动取消相关服务。
法律建议：
- 及时沟通：如果您发现银行卡免密支付功能关闭后仍有逾期费用被扣款，建议首先与银行进行沟通，了解扣款的具体原因和依据。
- 审查协议：仔细审查与银行签订的相关协议，特别是关于自动扣款和逾期费用处理的条款，以了解自己的权利和义务。
- 采取措施：如果认为银行的扣款行为存在不当或违法情况，您可以向银行提出异议，并要求银行停止扣款或退还已扣款项。如果银行不予理会或处理不当，您可以考虑向相关监管机构投诉或寻求法律援助。
可能后果：
- 如果逾期费用确实存在且银行有权扣款，那么您可能需要承担逾期费用及其可能产生的滞纳金或利息等额外费用。
- 如果银行的扣款行为存在不当或违法情况，您可能有权要求银行停止扣款、退还已扣款项，并可能获得一定的赔偿。
总之，银行卡免密支付关闭后逾期是否还会扣钱，取决于逾期费用的性质、银行卡的扣款权限以及银行的具体操作。如果您对此有疑问或担忧，建议及时与银行沟通并审查相关协议。如有需要，也可以直接向我咨询相关法律问题。