破产程序终结后，案件的管辖权通常不再由破产法院专属管辖，而是根据具体纠纷类型回归普通民事诉讼程序或行政程序，由有管辖权的法院或机构处理。以下是具体分析：

1. 普通民事纠纷的管辖权
   破产程序终结后，若涉及与破产企业相关的普通民事纠纷（如合同纠纷、侵权纠纷等），管辖权回归一般民事诉讼规则。根据《民事诉讼法》规定，通常由被告住所地或合同履行地法院管辖。例如，若破产企业与第三方存在未了结的合同纠纷，债权人可向被告住所地或合同履行地法院提起诉讼，不再受破产法院专属管辖限制。

2. 破产衍生诉讼的管辖权
   若纠纷属于破产程序终结后新发现的破产财产分配、债权确认等衍生问题，可能仍需由原破产法院管辖。根据《企业破产法》及相关司法解释，破产程序终结后，若发现破产企业有应当追回的财产或存在未处理的债权债务，管理人或债权人可向原破产法院申请恢复破产程序或提起相关诉讼。此时，原破产法院因熟悉破产案件背景，通常具有管辖权。

3. 行政或刑事案件的管辖权
   若涉及破产企业的行政处罚或刑事犯罪问题，管辖权由行政机关或刑事司法机关根据相关法律确定。例如，若破产企业在破产前存在环境污染等违法行为，环保部门可依法进行行政处罚，不受破产程序终结影响；若涉嫌犯罪，则由公安机关立案侦查，检察院提起公诉，法院依法审判。

总结：破产程序终结后，管辖权需根据纠纷性质区分处理。普通民事纠纷回归一般管辖规则，破产衍生诉讼可能由原破产法院管辖，行政或刑事案件则由相应机关处理。若您有具体案件或纠纷类型，可进一步向我咨询，我将结合实际情况为您详细分析。