拆迁协议在办理房产证时是否会被收回，主要取决于当地的具体规定和操作流程，没有统一的答案。以下是对这一问题的详细分析：

1. 可能被收回的情况：

   • 在某些地区，为了确保资料的完整性和存档需要，房管局或相关部门可能会要求将拆迁协议原件收回存档。这种做法主要是为了在后续可能出现的产权纠纷、档案查阅等情况时有原始依据，方便查证房屋产权来源及相关拆迁安置情况。例如，一些城市政府统一规划的大规模拆迁安置项目，为规范管理档案，可能会统一收回拆迁协议原件。

2. 可能不收回的情况：

   • 在多数地区，办理房产证时只需要提供拆迁协议的复印件，核实原件后将原件退还业主。这是因为拆迁协议是购房者与拆迁方之间极为重要的法律文书，用于证实房屋的由来及相关的权益情况。业主后续可能在其他方面还会用到拆迁协议原件，如涉及到拆迁安置的一些补充协议签署、相关费用结算等。

3. 法律建议与操作指南：

   • 提前咨询：不论所在地区是否要求收回拆迁协议，被拆迁人都应提前向当地的房产管理部门或不动产登记中心咨询了解具体的要求和流程，以便提前做好准备。
   • 妥善保管：拆迁协议是保护自身权益的重要凭证，被拆迁人应妥善保管自己所持有的拆迁协议原件，避免丢失或损坏。
   • 合法维权：如果发现拆迁协议原件丢失或被非法扣留，应及时与相关部门沟通协商，通过合法途径维护自身权益。例如，可以向相关部门提出书面申请，要求返还拆迁协议原件，或者寻求法律援助，通过法律途径解决纠纷。

总结：拆迁协议在办理房产证时是否会被收回，没有固定的规则，而是取决于当地的具体规定和操作流程。因此，建议被拆迁人在办理房产证前务必咨询当地相关部门，了解清楚具体要求，并妥善保管好自己的拆迁协议原件。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将根据你的具体情况提供专业的法律意见。