结论：工程内容大量甩项时，总包管理费是否可以扣除甩项内容，这并非一个绝对的问题，而是需要根据具体情况，特别是合同中的相关约定以及甩项的具体原因来综合判断。
分析角度一：合同约定
合同中有明确约定：如果总包合同中明确规定了甩项情况下总包管理费的调整方式，比如明确约定了甩项部分的管理费可以扣除或者按一定比例扣除，那么应当遵循合同的约定。这种情况下，总包管理费扣除甩项内容是有合同依据的。
合同中没有明确约定：如果合同中没有对甩项情况下总包管理费的调整做出明确规定，那么就需要根据合同的其他条款以及行业惯例、公平原则等进行综合判断。此时，总包方可能难以直接主张扣除甩项内容的管理费，但可以通过协商、调解或诉讼等方式寻求合理的解决方案。
分析角度二：甩项原因
发包方原因导致的甩项：如果甩项是由于发包方的原因，如设计变更、资金问题等导致的，那么总包方在主张扣除甩项内容的管理费时，可能会得到更多的支持。因为这种情况下，甩项并非总包方的责任，总包方有权要求发包方承担相应的损失。
总包方原因导致的甩项：如果甩项是由于总包方自身的原因，如施工能力不足、管理不善等导致的，那么总包方在主张扣除甩项内容的管理费时，可能会面临更大的困难。因为这种情况下，甩项是总包方的责任，发包方有权要求总包方承担相应的责任，包括可能的管理费损失。
法律建议：
审查合同：首先，总包方应仔细审查合同中的相关条款，特别是关于甩项和管理费调整的约定。如果合同中有明确规定，应遵循合同的约定执行。
协商沟通：如果合同中没有明确规定或者规定不明确，总包方应与发包方进行协商沟通，寻求双方都能接受的解决方案。在协商过程中，总包方可以提出自己的合理诉求，并听取发包方的意见和建议。
寻求法律支持：如果协商无果或者发包方拒绝承担相应的责任，总包方可以寻求法律支持，通过诉讼或仲裁等方式解决争议。在诉讼或仲裁过程中，总包方需要提供充分的证据证明自己的诉求是合理的。
可能后果：
如果总包方能够成功主张扣除甩项内容的管理费，那么将减少其因甩项而产生的损失。
如果总包方未能成功主张扣除甩项内容的管理费，那么可能需要自行承担这部分损失，或者通过其他方式寻求补偿。
总之，工程内容大量甩项时，总包管理费是否可以扣除甩项内容需要根据具体情况综合判断。总包方应仔细审查合同、与发包方协商沟通，并在必要时寻求法律支持以维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。