关于破坏承重墙导致不动产不予登记的法律依据，主要可以从以下几个方面进行分析：
《中华人民共和国民法典》的相关规定：
- 根据《民法典》第二百八十六条，业主大会或者业主委员会，对任意弃置垃圾、排放污染物或者噪声、违反规定饲养动物、违章搭建、侵占通道、拒付物业费等损害他人合法权益的行为，有权依照法律、法规以及管理规约，请求行为人停止侵害、排除妨碍、消除危险、恢复原状、赔偿损失。破坏承重墙属于对房屋结构的严重破坏，直接威胁到整栋建筑的安全，损害了其他业主的合法权益，因此，相关业主或业主委员会有权要求行为人恢复原状。
- 同时，根据《民法典》第二百三十八条，侵害物权，造成权利人损害的，权利人可以依法请求损害赔偿，也可以依法请求承担其他民事责任。破坏承重墙的行为，无疑是对房屋物权的侵害，不动产登记机构在发现此类行为时，有权依据相关法律法规，拒绝为相关房屋办理不动产登记手续，直至违法行为得到纠正。
《物业管理条例》的相关规定：
- 根据《物业管理条例》第四十五条，对物业管理区域内违反有关治安、环保、物业装饰装修和使用等方面法律、法规规定的行为，物业服务企业应当制止，并及时向有关行政管理部门报告。破坏承重墙属于物业装饰装修和使用方面的违法行为，物业服务企业有责任制止，并向相关行政管理部门报告。
- 行政管理部门在接到报告后，应依法对违法行为进行查处，并要求行为人恢复原状。在违法行为未得到纠正前，不动产登记机构可以依据相关法律法规，拒绝为相关房屋办理不动产登记手续。
《不动产登记暂行条例》及其实施细则的相关规定：
- 虽然《不动产登记暂行条例》及其实施细则并未直接规定破坏承重墙导致不动产不予登记的具体情形，但根据条例的精神和原则，不动产登记机构在办理登记时，应确保房屋的结构安全和使用功能不受影响。
- 破坏承重墙的行为严重影响了房屋的结构安全和使用功能，因此，不动产登记机构在发现此类行为时，有权依据相关法律法规和登记规定，拒绝为相关房屋办理不动产登记手续，以保护公共利益和其他业主的合法权益。
法律后果与建议：
- 破坏承重墙的行为不仅可能导致不动产登记受阻，还可能面临行政处罚、民事赔偿等法律后果。行为人需承担恢复原状、赔偿损失等民事责任，并可能受到相关行政部门的罚款等行政处罚。
- 对于已经发生破坏承重墙行为的房屋，建议行为人立即停止违法行为，并委托专业机构进行结构安全评估，根据评估结果采取相应的加固措施，以确保房屋的结构安全和使用功能。在违法行为得到纠正后，再向不动产登记机构申请办理不动产登记手续。
总结：破坏承重墙的行为严重违反了相关法律法规和建筑安全标准，不动产登记机构在发现此类行为时，有权依据相关法律法规拒绝为相关房屋办理不动产登记手续。行为人应立即停止违法行为，并采取相应的加固措施以纠正违法行为，确保房屋的结构安全和使用功能。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。