当企业同时违反《反不正当竞争法》和《商标法》时，会面临行政处罚、民事赔偿以及可能的刑事责任，具体处理方式如下：
行政处罚：
- 反不正当竞争法方面：根据该法，不正当竞争行为可能包括混淆行为（如擅自使用与他人有一定影响的商品名称、包装、装潢等相同或者近似的标识）、虚假宣传、商业诋毁等。监管部门（如市场监督管理局）有权责令停止违法行为，没收违法所得，并处以罚款。罚款的数额根据违法行为的性质、情节等因素确定，可能从几万元到数百万元不等。
- 商标法方面：违反商标法的行为主要包括未经商标注册人的许可，在同一种商品上使用与其注册商标相同的商标（即假冒注册商标）、销售侵犯注册商标专用权的商品等。对于这类行为，工商行政管理部门同样会责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，并处以罚款。情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
民事赔偿：
- 反不正当竞争法方面：因不正当竞争行为受到损害的经营者，有权向人民法院提起诉讼，要求侵权人承担民事赔偿责任。赔偿数额通常按照因侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以计算的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定。
- 商标法方面：侵犯商标专用权的赔偿数额，同样按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；实际损失难以确定的，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定；权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定的，参照该商标许可使用费的倍数合理确定。对恶意侵犯商标专用权，情节严重的，还可以按照上述方法确定数额的一倍以上五倍以下确定赔偿数额。
刑事责任：
- 如果企业的违法行为情节严重，构成犯罪的，将依法追究刑事责任。例如，假冒注册商标罪、销售假冒注册商标的商品罪等。这些犯罪行为通常涉及较大的销售额或违法所得，且对社会造成较为严重的危害。
综合处理建议：
- 立即停止违法行为：企业一旦发现自身存在违反《反不正当竞争法》和《商标法》的行为，应立即停止，以避免进一步的法律后果。
- 配合调查：积极配合相关监管部门的调查工作，如实提供有关情况和证据材料。
- 寻求法律帮助：及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，制定合适的应对策略。律师可以帮助企业评估法律风险、准备相关证据材料、参与谈判或诉讼等。
- 加强内部管理：企业应加强对内部管理流程的审查和监督，确保各项经营活动符合法律法规的要求，避免类似违法行为再次发生。
企业同时违反这两部法律时，会面临多方面的法律后果。因此，建议企业加强法律意识，严格遵守相关法律法规，确保经营活动的合法性和合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。