刑事案件中，违反刑法但检察院不起诉是否会留下案底，主要取决于不起诉的具体类型及案情。以下是对此问题的详细分析：

1. 法定不起诉（绝对不起诉）：

   • 情形：包括情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的；依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的；犯罪嫌疑人、被告人死亡的；其他法律规定免予追究刑事责任的。
   • 结果：在这些情形下，由于犯罪嫌疑人根本不构成犯罪或者依法不应被追究刑事责任，因此不会留下案底。

2. 酌定不起诉（相对不起诉）：

   • 情形：犯罪嫌疑人的犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的。
   • 结果：虽然犯罪嫌疑人的行为已构成犯罪，但由于情节轻微等原因未起诉，这种情况下理论上可能会在司法机关内部系统留下相关记录。这种记录并非通常所说的“案底”，但在某些特定职业准入、资格审查等方面可能产生影响。不过，目前部分地区对于符合特定条件的酌定不起诉案件，会探索进行案底封存等特殊处理方式，以减少对当事人的不利影响。

3. 证据不足不起诉：

   • 情形：对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的。
   • 结果：因现有证据无法证明犯罪嫌疑人有罪，遵循疑罪从无原则，不会留下案底。但需要注意的是，如果后续发现新证据且符合起诉条件，人民检察院可以重新提起公诉。

额外说明：

• 案底定义：案底一般指某人过去犯罪行为的记录，即犯罪人员犯罪记录制度，在我国法律中通常指有过刑事犯罪前科的档案记录。
• 无起诉无案底原则：检察院决定不起诉意味着在法律层面上当事人并未被认定为犯罪，因此不会产生犯罪记录，即不会有案底。
• 特殊记录影响：尽管未起诉通常不会留下案底，但相关记录可能在司法机关存档，并在特定情况下被查询和参考。这些记录并不等同于正式案底，其对个人的长期影响有限且具体视情况而定。

建议：

• 如果您或您身边的人面临类似情况，建议及时咨询专业律师，以便更准确地了解案件性质及可能产生的法律后果。
• 对于酌定不起诉的情况，可以积极了解当地是否有案底封存等特殊处理政策，以减少对个人生活的影响。

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