农村土地流转后土地补偿款的归属，主要取决于土地流转的具体内容和双方约定。以下是详细分析：

1. 土地流转仅涉及经营权

   • 在这种情况下，土地的承包权依然保留在原承包农户手中，只是将土地的经营权进行了流转。因此，当土地被征收时，土地补偿款应归原承包农户所有。这是因为土地承包权是农户基于农村集体成员身份所享有的核心权益，不会因经营权的流转而改变。例如，农户A将土地流转给农户B耕种，但承包权仍在农户A手中，若此时土地被征收，补偿款应归农户A。

2. 土地流转包含承包经营权

   • 如果土地流转不仅涉及经营权，还包含了承包权，并且这一流转经过了发包方的同意，同时也对承包合同进行了相应的变更，那么新的土地承包人就成为了合法的权益享有者。因此，当土地被征收时，补偿款应当归新的土地承包人所有。这种情况下，原承包方与发包方的承包关系已经终止，新的承包方享有该土地的全部权益，包括获得土地流转补偿的权利。

3. 特殊约定情况

   • 在土地流转合同中，如果双方对于土地被征收后补偿款的归属有明确且合法的约定，那么这一约定将具有优先效力。无论土地流转的是经营权还是承包经营权，只要合同中的约定不违反法律法规的强制性规定，就应当按照约定来分配补偿款。这种约定应当以书面形式清晰记录，以避免未来产生不必要的纠纷。例如，双方可以约定在土地流转期间，若土地被征收，补偿款按一定比例分配给原承包方和受让方。

4. 地上附着物和青苗补偿费的区分

   • 在处理土地流转后的补偿问题时，还需要特别注意对地上附着物和青苗补偿费的区分。这部分补偿是对土地上实际投入和生长物的补偿，一般遵循“谁投入、谁种植、谁管理，补偿就归谁”的原则。例如，如果流转土地上的果树是由受让方种植的，那么果树的补偿款就应归受让方所有。同样，如果受让方在土地上种植了农作物，那么这些农作物的补偿款也应归受让方所有。

法律建议：

• 在实际操作中，建议当事人在签订土地流转合同时，务必明确补偿款的归属问题。合同中应详细列明土地流转的具体内容、双方的权利和义务、补偿款的分配方式等关键条款，以减少未来的纠纷和风险。
• 如果双方对补偿款的归属存在争议，可以首先尝试通过协商解决。如果协商不成，可以寻求当地农村土地承包仲裁委员会的仲裁或者向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

可能法律后果：

• 如果土地流转合同中没有明确补偿款的归属问题，或者约定不明确，那么在土地被征收时，双方可能会因补偿款的分配问题产生纠纷。这种情况下，可能需要通过法律途径来解决争议，这可能会耗费双方大量的时间和精力，并可能带来不必要的经济损失。

综上所述，农村土地流转后土地补偿款的归属是一个复杂的问题，需要根据土地流转的具体内容、双方约定以及相关法律法规进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。