承运人在赔偿托运人损失后，仍有权主张支付运费的，可通过协商、诉讼或仲裁等方式申请，具体操作如下：

1. 协商解决
   承运人可优先与托运人协商，明确运费支付义务不因赔偿而免除。根据《民法典》第八百三十三条，承运人对货物的毁损、灭失承担赔偿责任后，若合同未约定运费免除，托运人仍需支付运费。协商时需保留书面沟通记录（如邮件、微信等），作为后续主张的证据。

2. 诉讼途径
   若协商无果，承运人可向法院提起诉讼，要求托运人支付运费。需准备以下材料：

   • 基础证据：运输合同、运单、货物交接单等，证明双方存在运输关系及运费金额；
     
   • 赔偿证据：赔偿协议、付款凭证、损失评估报告等，证明承运人已履行赔偿义务；
     
   • 法律依据：引用《民法典》第八百三十三条，说明赔偿与运费支付为独立法律关系，托运人不得以赔偿为由拒付运费。
     诉讼中需注意时效问题，一般诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受损之日起计算。

3. 仲裁申请（若合同有约定）
   若运输合同中约定了仲裁条款，承运人需向约定的仲裁机构提交仲裁申请，流程与诉讼类似，但需遵循仲裁规则。仲裁裁决具有终局性，效率通常高于诉讼。

操作建议：

• 合同签订时明确约定“赔偿与运费支付互不影响”，避免争议；
  
• 赔偿后及时书面催告托运人支付运费，保留催告证据；
  
• 若托运人拒付理由为“承运人过错导致损失”，需评估自身是否存在过错，避免被反诉。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。