结论概述：工程款收到后没有及时上交，过几个月再上交可能会面临合同违约责任、公司内部管理处罚以及可能的税务风险。具体后果需根据合同条款、公司内部规定以及相关法律法规来综合判断。

1. 合同违约责任：

• 法律背景：在建设工程合同中，通常会明确约定工程款的支付时间、方式以及违约责任等条款。如果合同中明确规定了工程款应及时上交（如上交至公司账户或指定账户），而实际未按时上交，则可能构成违约。
• 可能后果：根据合同约定，违约方可能需要承担违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。违约金的数额通常会在合同中明确约定，如果未约定，则可能根据实际损失来确定。

2. 公司内部管理处罚：

• 法律背景：除了合同约定外，公司内部也可能有关于工程款管理的规定。这些规定可能涉及工程款的收取、上交、使用等各个环节。
• 可能后果：如果违反了公司内部的管理规定，公司可能会根据内部规定对相关责任人进行处罚，如警告、罚款、降职等。这些处罚的严重程度通常取决于违规的性质和后果。

3. 税务风险：

• 法律背景：工程款的上交可能涉及税务问题。如果工程款未及时上交，可能导致公司无法及时申报和缴纳相关税款，从而面临税务风险。
• 可能后果：税务机关可能对公司进行税务稽查，并要求补缴税款、滞纳金以及可能的罚款。在严重情况下，还可能涉及刑事责任。

4. 其他潜在风险：

• 信誉损失：未及时上交工程款可能影响公司的信誉和形象，对未来的业务合作产生不利影响。
• 法律纠纷：如果因未及时上交工程款而引发法律纠纷，公司可能需要投入大量时间和资源来应对诉讼或仲裁等法律程序。

建议与措施：

• 及时沟通：如果因特殊原因无法及时上交工程款，应及时与公司沟通并说明情况，寻求解决方案。
• 遵守合同与公司规定：严格按照合同和公司内部规定来操作，确保工程款的及时上交和使用。
• 加强税务管理：确保公司税务申报的准确性和及时性，避免因税务问题而引发的风险。

特殊情况说明：

• 如果合同或公司内部规定中未明确约定工程款的上交时间或方式，或者存在模糊不清的情况，建议及时与公司或合同相对方进行协商并明确相关条款，以避免未来可能出现的纠纷。

如有任何关于建设工程款管理的法律问题或疑虑，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。